coefCI

Класс: LinearMixedModel

Доверительные интервалы для коэффициентов линейной модели смешанных эффектов

Описание

пример

feCI = coefCI(lme) возвращает 95% доверительные интервалы для коэффициентов с фиксированными эффектами в модели линейных смешанных эффектов lme.

пример

feCI = coefCI(lme,Name,Value) возвращает 95% доверительные интервалы для коэффициентов с фиксированными эффектами в модели линейных смешанных эффектов lme с дополнительными опциями, заданными одним или несколькими Name,Value аргументы в виде пар.

Для примера можно задать уровень доверия или метод для вычисления степеней свободы.

пример

[feCI,reCI] = coefCI(___) также возвращает 95% доверительные интервалы для коэффициентов случайных эффектов в модели линейных смешанных эффектов lme.

Входные параметры

расширить все

Линейная модель смешанных эффектов, заданная как LinearMixedModel объект, созданный с использованием fitlme или fitlmematrix.

Аргументы в виде пар имя-значение

Задайте необязательные разделенные разделенными запятой парами Name,Value аргументы. Name - имя аргумента и Value - соответствующее значение. Name должны находиться внутри кавычек. Можно задать несколько аргументов в виде пар имен и значений в любом порядке Name1,Value1,...,NameN,ValueN.

Уровень значимости, заданный как разделенная разделенными запятой парами, состоящая из 'Alpha' и скалярное значение в области значений от 0 до 1. Для значения α доверительный уровень равен 100 * (1-α)%.

Для примера для 99% интервалов доверия можно задать уровень доверия следующим образом.

Пример: 'Alpha',0.01

Типы данных: single | double

Метод для вычисления приблизительных степеней свободы для расчета доверительного интервала, заданный как разделенная разделенными запятой парами, состоящая из 'DFMethod' и одно из следующих.

'residual'По умолчанию. Степени свободы приняты постоянными и равными n - p, где n - количество наблюдений и p - количество фиксированных эффектов.
'satterthwaite'Саттертвейское приближение.
'none'Все степени свободы установлены в бесконечность.

Например, можно задать приближение Саттертвейта следующим образом.

Пример: 'DFMethod','satterthwaite'

Выходные аргументы

расширить все

Доверительные интервалы с фиксированными эффектами, возвращенные как p-на-2 матрица. feCI содержит пределы доверия, которые соответствуют p оценкам фиксированных эффектов в векторе beta возвращен fixedEffects способ. Первый столбец feCI имеет более низкие доверительные пределы, а второй столбец имеет верхние доверительные пределы.

Доверительные интервалы случайных эффектов, возвращенные как q-на-2 матрица. reCI содержит пределы доверия, соответствующие q оценкам случайных эффектов в векторе B возвращен randomEffects способ. Первый столбец reCI имеет более низкие доверительные пределы, а второй столбец имеет верхние доверительные пределы.

Примеры

расширить все

Загрузите выборочные данные.

load('weight.mat')

weight содержит данные продольного исследования, где 20 субъектов случайным образом назначены для 4 программ упражнений, и их потеря веса регистрируется в течение шести 2-недельных периодов времени. Это моделируемые данные.

Сохраните данные в таблице. Определите Subject и Program как категориальные переменные.

tbl = table(InitialWeight, Program, Subject,Week, y);
tbl.Subject = nominal(tbl.Subject);
tbl.Program = nominal(tbl.Program);

Подгонка линейной модели смешанных эффектов, где начальный вес, тип программы, неделя и взаимодействие между неделей и типом программы являются фиксированными эффектами. Точка пересечения и неделя варьируются в зависимости от субъекта.

lme = fitlme(tbl,'y ~ InitialWeight + Program*Week + (Week|Subject)');

Вычислите оценки коэффициентов с фиксированными эффектами.

fe = fixedEffects(lme)
fe = 9×1

    0.6610
    0.0032
    0.3608
   -0.0333
    0.1132
    0.1732
    0.0388
    0.0305
    0.0331

Первая оценка, 0,6610, соответствует постоянному члену. Вторая строка, 0,0032, и третья строка, 0,3608, являются оценками для коэффициента начального веса и недели, соответственно. Строки с четырех по шесть соответствуют переменным индикатора для программ B-D, а последние три строки соответствуют взаимодействию программ B-D и недели.

Вычислите 95% доверительные интервалы для коэффициентов с фиксированными эффектами.

fecI = coefCI(lme)
fecI = 9×2

    0.1480    1.1741
    0.0005    0.0059
    0.1004    0.6211
   -0.2932    0.2267
   -0.1471    0.3734
    0.0395    0.3069
   -0.1503    0.2278
   -0.1585    0.2196
   -0.1559    0.2221

Некоторые доверительные интервалы включают 0. Чтобы получить конкретный p-значения для каждого термина с фиксированными эффектами, используйте fixedEffects способ. Чтобы протестировать на целые условия, используйте anova способ.

Загрузите выборочные данные.

load carbig

Подгонка линейной модели смешанных эффектов для миль на галлон (MPG) с фиксированными эффектами для ускорения и лошадиной силы и потенциально коррелированным случайным эффектом для точки пересечения и ускорения, сгруппированными по модельным годам. Сначала сохраните данные в таблице.

tbl = table(Acceleration,Horsepower,Model_Year,MPG);

Подгонка модели.

lme = fitlme(tbl, 'MPG ~ Acceleration + Horsepower + (Acceleration|Model_Year)');

Вычислите оценки коэффициентов с фиксированными эффектами.

fe = fixedEffects(lme)
fe = 3×1

   50.1325
   -0.5833
   -0.1695

Вычислите 99% доверительные интервалы для коэффициентов с фиксированными эффектами с помощью метода невязок, чтобы определить степени свободы. Это метод по умолчанию.

feCI = coefCI(lme,'Alpha',0.01)
feCI = 3×2

   44.2690   55.9961
   -0.9300   -0.2365
   -0.1883   -0.1507

Вычислите 99% доверительные интервалы для коэффициентов с фиксированными эффектами, используя саттертвейтское приближение, чтобы вычислить степени свободы.

feCI = coefCI(lme,'Alpha',0.01,'DFMethod','satterthwaite')
feCI = 3×2

   44.0949   56.1701
   -0.9640   -0.2025
   -0.1884   -0.1507

Саттертвейтское приближение создает такие же доверительные интервалы, как и остаточный метод.

Загрузите выборочные данные.

load('shift.mat')

Данные показывают отклонения от целевой характеристики качества, измеренные по продуктам, которые пять операторов производят в три сдвигов: утреннюю, вечернюю и ночную. Это рандомизированный проект блока, где операторы являются блоками. Эксперимент предназначен для изучения влияния времени сдвига на эффективность. Показателем эффективности является отклонение характеристик качества от целевого значения. Это моделируемые данные.

Shift и Operator являются номинальными переменными.

shift.Shift = nominal(shift.Shift);
shift.Operator = nominal(shift.Operator);

Подгонка модели линейных смешанных эффектов со случайной точкой пересечения, сгруппированным оператором, чтобы оценить, существует ли значительное различие в эффективности в соответствии со временем сдвига.

lme = fitlme(shift,'QCDev ~ Shift + (1|Operator)');

Вычислите оценку BLUP для случайных эффектов.

randomEffects(lme)
ans = 5×1

    0.5775
    1.1757
   -2.1715
    2.3655
   -1.9472

Вычислите 95% доверительные интервалы для случайных эффектов.

[~,reCI] = coefCI(lme)
reCI = 5×2

   -1.3916    2.5467
   -0.7934    3.1449
   -4.1407   -0.2024
    0.3964    4.3347
   -3.9164    0.0219

Вычислите 99% доверительные интервалы для случайных эффектов с помощью метода невязок, чтобы определить степени свободы. Это метод по умолчанию.

[~,reCI] = coefCI(lme,'Alpha',0.01)
reCI = 5×2

   -2.1831    3.3382
   -1.5849    3.9364
   -4.9322    0.5891
   -0.3951    5.1261
   -4.7079    0.8134

Вычислите 99% доверительные интервалы для случайных эффектов, используя саттертвейтское приближение, чтобы определить степени свободы.

[~,reCI] = coefCI(lme,'Alpha',0.01,'DFMethod','satterthwaite')
reCI = 5×2

   -2.6840    3.8390
   -2.0858    4.4372
   -5.4330    1.0900
   -0.8960    5.6270
   -5.2087    1.3142

Саттертвейское приближение может привести к меньшим DF значения, чем остаточный метод. Вот почему эти интервалы доверия больше, чем предыдущие таковые, вычисленные с помощью остаточного метода.

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте