Пример модели

Следующий рисунок показывает модель Подсчета клеток примера.

Камеры сегментов

Внутри подсистемы Isolate Cells, пример использует комбинацию морфологического расширения и арифметических операций с изображениями, чтобы удалить неравномерное освещение и подчеркнуть контуры между камерами. Из-за изменений общей интенсивности подсветки пример не может применить одно пороговое значение ко всем видеокадрам. Пример использует блок Autothreshold для вычисления порога для каждой системы координат.

Подсистема изоляции камер:

Результаты подсчета клеток

После того, как пример применяет порог и разделяет камеры, он использует блок Blob-анализа объектов для подсчета количества камер в каждой системе координат и вычисления центроида каждой камеры. Пример передает общее количество камер в каждой системе координат блоку Insert Text, который находится в подсистеме Display Results. Этот блок встраивает эту информацию в каждый видеокадр.

Окно скорости деления камер показывает экспоненциальный рост бактерий.

Окно Results отображает одну систему координат исходных видео и зеленых маркеров, указывающих центральное местоположение найденных камер. Номер системы координат и количество камер отображаются в левом верхнем углу.

Кредиты набора данных

Набор данных для этого примера был предоставлен Джонатаном Янгом и Майклом Эловицем из Калифорнийского технологического института ®. Используется с разрешением. Для получения дополнительной информации об этих данных см.

N. Rosenfeld, J. Young, U. Alon, P. Swain, and M.B. Elowitz, «Gene Regulation at the Single-Cell Level», Science 2005, Vol. 307, pp. 1962-1965.