getRange

Класс: GTFAnnotation

Получите область значений аннотаций от GTFAnnotation объект

Синтаксис

Range = getRange(AnnotObj)

Описание

Range = getRange(AnnotObj) возвращает Range, 1 2 числовой массив, задающий минимальные и максимальные положения в ссылочной последовательности, охвачен аннотациями в AnnotObj.

Входные параметры

AnnotObj

Объект GTFAnnotation класс.

Выходные аргументы

Range

1 2 числовой массив, задающий минимальные и максимальные положения в ссылочной последовательности, охвачен аннотациями в AnnotObj

Примеры

Создайте a GTFAnnotation объект из отформатированного GTF файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем возвращает область значений аннотаций функции:

% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file
GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf');
% Return first and last positions of reference associated with feature annotations
range = getRange(GTFAnnotObj)
range =

       41609     1371382

Советы

  • Используйте getSubset метод с Reference пара "имя-значение", чтобы возвратить a GFFAnnotation объект, содержащий только одну ссылочную последовательность. Затем используйте этот объект из подмножества, как введено для getRange метод.

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте