Запишите нескольким выравнивание в файл
multialignwrite(File, Alignment)
multialignwrite(..., 'Format', FormatValue,
...)
multialignwrite(..., 'Header', HeaderValue,
...)
multialignwrite(..., 'WriteCount', WriteCountValue,
...)
multialignwrite( записывает содержимое выравнивания к ClustalW ALN-отформатированный или MSF-отформатированный файл (по умолчанию).File, Alignment)
multialignwrite (..., ' вызовы PropertyName', PropertyValue, ...)multialignwrite с дополнительными свойствами, которые используют имя свойства / пары значения свойства. Можно задать одно или несколько свойств в любом порядке. Заключите каждый PropertyName в одинарных кавычках. Каждый PropertyName является нечувствительным к регистру. Это имя свойства / пары значения свойства следующие:
multialignwrite(..., 'Format', задает формат файла. FormatValue,
...)FormatValue может быть 'ALN' (значение по умолчанию) или 'MSF'.
multialignwrite(..., 'Header', задает первую строку файла. Значение по умолчанию для HeaderValue,
...)HeaderValue 'MATLAB multiple sequence alignment'.
multialignwrite(..., 'WriteCount', задает, добавить ли количества остатка в конец каждой линии. WriteCountValue,
...)WriteCountValue может быть true (значение по умолчанию) или false.
|
Выравнивание, такой, как возвращено |
|
Вектор символов или строка, задающая или имя файла или путь и имя файла для того, чтобы сохранить данные. Если вы задаете только имя файла, файл сохранен в MATLAB® Браузер текущей папки. Совет Если вы используете Ниже столбцов ClustalW ALN-отформатированный файл символы могут появиться, которые обозначают:
Для получения дополнительной информации об этих символах и группах остатков, рассмотренных сохраненными и полусохраненными, смотрите раздел 12 в “Изменениях начиная с версии 1.6” в |
|
Вектор символов или строка, которая задает формат Совет Можно также записать в MSF-отформатированный файл при помощи |
|
Вектор символов или строка, которая задает первую строку файла. Совет Используйте Значение по умолчанию: |
|
Задает, добавить ли количества остатка в конец каждой линии. Выбором является |
Используйте fastaread функционируйте, чтобы считать p53samples.txt, FASTA-отформатированный файл включал с программным обеспечением Bioinformatics Toolbox™, которое содержит семь сотовых антигенов опухоли p53 последовательности.
p53 = fastaread('p53samples.txt')
p53 =
7x1 struct array with fields:
Header
SequenceИспользуйте multialign функция, чтобы выровнять семь сотовых антигенов опухоли p53 последовательности.
ma = multialign(p53,'verbose',true);Запишите выравнивание в файл с именем p53.aln.
multialignwrite('p53.aln',ma)fastaread | fastawrite | gethmmalignment | multialign | multialignread | seqalignviewer | phytreewrite | seqconsensus | seqdisp | seqprofile