Преобразуйте пиксельные индексы от одного уровня до другого через мировые координаты, чтобы относиться к той же пространственной области.

Создайте блокированное изображение из демонстрационного изображения, включенного с тулбоксом.

bim = blockedImage('tumor_091R.tif');

Задайте необходимую область на самом прекрасном уровне разрешения в пиксельных индексах.

level1PixelSubStart = [1700, 1550 1];
level1PixelSubEnd = [2100, 2000 3];

Получите данные изображения от необходимой области на изображении уровня 1 разрешения.

imr = getRegion(bim, level1PixelSubStart, level1PixelSubEnd, "Level", 1);
size(imr)

ans = 1×3

   401   451     3

Преобразуйте пиксельные индексы, которые задают необходимую область в мировые координаты. По умолчанию, sub2world преобразует координаты на уровне 1, самом прекрасном разрешении.

worldRegion = sub2world(bim,[level1PixelSubStart; level1PixelSubEnd]);

Вычислите бинарную маску на самом грубом уровне.

bbw = apply(bim, @(bs)imbinarize(im2gray(bs.Data)), "Level", 3);

Преобразуйте мировые координаты необходимой области к пиксельным индексам маски. Обратите внимание на то, что маска имеет только две размерности.

worldRegion = worldRegion(:,1:2);
maskPixelSubs = world2sub(bbw,worldRegion);

Соответствующая область маски.

bwr = getRegion(bbw, maskPixelSubs(1,:), maskPixelSubs(2,:));
size(bwr)

ans = 1×2

    51    58

Просмотрите оригинальное изображение и маску.

montage({imr,bwr})