niftiread

Считайте изображение NIfTI

свернуть все на странице

Синтаксис

V = niftiread(filename)
V = niftiread(headerfile,imgfile)
V = niftiread(info)

Описание

пример

V = niftiread(filename) читает файл изображения NIfTI, заданный filename в текущей папке или на пути, и возвращает объемные данные в V. niftiread функционируйте поддерживает обоих NIfTI1 и NIfTI2 форматы файлов.

V = niftiread(headerfile,imgfile) читает заголовочный файл NIfTI (.hdr) и файл изображения (.img) пара.

пример

V = niftiread(info) читает файл NIfTI, описанный структурой метаданных info. Создать info структура, используйте niftiinfo функция

Примеры

свернуть все

Скрипт Open Live Script

Загрузите объемные данные из файла NIfTI. Файл использует объединенный формат NIfTI — изображение и метаданные находятся в том же файле. Этот тип файла NIfTI имеет .nii расширение файла.

V = niftiread('brain.nii');

Просмотрите переменную в рабочей области.

whos V
  Name        Size                  Bytes  Class    Attributes

  V         256x256x21            1376256  uint8
Скрипт Open Live Script

Считайте метаданные из файла NIfTI. 

info = niftiinfo('brain.nii');

Считайте объемное изображение с помощью структуры метаданных, возвращенной niftiinfo.

V = niftiread(info);

Просмотрите переменную в рабочей области.

whos V
  Name        Size                  Bytes  Class    Attributes

  V         256x256x21            1376256  uint8

Входные параметры

свернуть все

Имя файла NIfTI в виде строкового скаляра или вектора символов. Файл может быть в NIfTI1 или NIfTI2 fileFormat .

  • Если вы не задаете расширение файла, то niftiread ищет файл с .nii расширение.

  • Если niftiread не может найти файл с .nii расширение, затем это ищет gzipped версию файла с дополнительным .nii.gz.

  • Если niftiread не может найти файл с .nii.gz расширение, затем это ищет файл с .hdr, .hdr.gzimg , или .img.gz расширение файла.

  • Если niftiread не может найти файл, который совпадает с любой из этих опций, затем он возвращает ошибку.

Типы данных: char | string

Имя файла, содержащего метаданные в виде строкового скаляра или вектора символов. Заголовочный файл NIfTI (.hdr) содержит метаданные, сопоставленные с объемом NIfTI. Если вы не задаете соответствующий imgfile, затем niftiread взгляды в той же папке для файла с тем же именем и дополнительным .img.

Типы данных: char | string

Имя файла, содержащего объем в виде строкового скаляра или вектора символов. Файл изображения NIfTI (.img) содержит данные об объеме. Если вы не задаете соответствующий заголовочный файл, то niftiread взгляды в той же папке для файла с тем же именем и дополнительным .hdr.

Типы данных: char | string

Метаданные файла NIfTI в виде структуры, возвращенной niftiinfo.

Типы данных: struct

Выходные аргументы

свернуть все

Объемные данные, возвращенные как числовой массив.

Больше о

свернуть все

Формат файла NIfTI

NIfTI (Нейроотображающий Технологическую Инициативу Информатики) является NIH-спонсируемой рабочей группой, чтобы способствовать функциональной совместимости функциональных программных инструментов нейрообработки изображений. NIfTI использует один или двойной формат хранилища файлов.

  • Двойной формат файла хранит данные в паре файлов: заголовочный файл (.hdr) содержа метаданные и файл данных (.img) содержа данные изображения.

  • Один формат файла хранит данные в одном файле (.nii), который содержит информацию о заголовке, сопровождаемую данными изображения.

Ссылки

[1] Cox, R. W. Дж. Ашбернер, Х. Бремен, К. Фисселл, К. Хэзелгроув, К. Дж. Холмс, Дж. Л. Ланкастер, Д. Э. Рекс, С. М. Смит, Дж. Б. Вудвард и С. К. Стразэ. "(Вид) новый стандарт формата данных изображения: NiFTI-1". 10-е Годовое собрание Организации Отображения Человеческого мозга, Будапешта, Венгрия, июнь 2004.

Смотрите также

|

Введенный в R2017b

Документация Image Processing Toolbox

Поддержка

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте