Сетевой анализ и визуализация

Примените основные алгоритмы теории графов к Взаимодействиям белка белка (PPI) и другим генным сетям; просмотрите сетевые отношения с помощью интерактивных карт, графиков иерархии и трасс

Используйте различные алгоритмы графика, чтобы анализировать генные сети и взаимодействия белка белка. Представляйте различные типы графиков с помощью разреженных матриц. Визуализируйте графики и сетевые отношения с помощью biograph объект, который позволяет вам вычислить положение узлов, чертит график и находит отношения между узлами.

Функции

graphallshortestpaths(Чтобы быть удаленным), Находят все кратчайшие пути в графике
graphconncomp(Чтобы быть удаленным), Находят строго или слабо соединенные компоненты в графике
graphisdag(Чтобы быть удаленным) Тест для циклов в ориентированном графе
graphisomorphism(Чтобы быть удаленным), Находят изоморфизм между двумя графиками
graphisspantree(Чтобы быть удаленным), Определяют, охватывает ли дерево дерево
graphmaxflow(Чтобы быть удаленным), Вычисляют максимальный поток в ориентированном графе
graphminspantree(Чтобы быть удаленным), Находят минимальное дерево охвата в графике
graphpred2path(Чтобы быть удаленным), Преобразуют индексы-предшественников в пути
graphshortestpath(Чтобы быть удаленным), Решают задачу кратчайшего пути в графике
graphtopoorder(Чтобы быть удаленным), Выполняют топологический вид направленного графа без петель
graphtraverse(Чтобы быть удаленным) график Пересечения следующими смежными узлами

Классы

biograph(Чтобы быть удаленным), Создают биообъект диаграмм
biograph object(Чтобы быть удаленным), Структура данных, содержащая типовые взаимосвязанные данные раньше, реализовывала ориентированного графа

Темы

Функции теории графов

Функции теории графов в Bioinformatics Toolbox™ применяют основные алгоритмы теории графов к разреженным матрицам.

Визуализация графика

Bioinformatics Toolbox включает функции, объекты и методы для создания, просмотра и управления графиками, такими как интерактивные карты, графики иерархии и трассы.

Рекомендуемые примеры