Анализ данных масс-спектрометрии
Функции масс-спектрометрии предварительно обрабатывают и классифицируют необработанные данные от SELDI-TOF и спектрометров MALDI-TOF и используют статистические функции изучения, чтобы идентифицировать шаблоны.
Чтение необработанных данных — масса/заряд сырых данных Загрузки и ионные данные об интенсивности из файлов "запятой разделила значение" (CSV), или считало файл JCAMP-DX-formatted с данными о масс-спектрометрии (jcampread) в MATLAB® среда.
Вы можете также иметь данные в файлах TXT и использовать importdata функция.
Предварительная обработка необработанных данных — Передискретизирует данные с высоким разрешением к более низкому разрешению (msresample) где дополнительные точки данных не нужны. Откорректируйте базовую линию (msbackadj). Выровняйте спектр к набору ссылочных масс (msalign) и визуально проверьте выравнивание (msheatmap). Нормируйте область между спектрами для сравнения (msnorm), и отфильтруйте шум (mslowess и mssgolay).
Анализ спектра — спектры Загрузки в графический интерфейс пользователя (msviewer) для выбора массового peaks и последующего анализа.
Следующая диаграмма иллюстрирует роли различных функций масс-спектрометрии в тулбоксе.
