Задайте опции анализа чувствительности
SensitivityAnalysisOptions
свойство является объектом, который содержит опции анализа чувствительности в объекте конфигурации модели. Анализ чувствительности поддерживается только для детерминированного (ОДУ) симуляции.
Примечание
SensitivityAnalysisOptions
свойство управляет настройками, связанными с анализом чувствительности. Чтобы включить или отключить анализ чувствительности, используйте SensitivityAnalysis
свойство.
Свойства SensitivityAnalysisOptions
получены в итоге в Сводных данных Свойства.
Когда анализ чувствительности включен, следующая команда
[t,x,names] = sbiosimulate(modelObj)
возвращает [t,x,names]
, где
t
n-by-1
вектор, где n
количество шагов, сделанных решателем оды и t
задает временные шаги решателя.
x
n-by-m
матрица, где n
количество шагов, сделанных решателем оды и m
:
Number of species and parameters specified in StatesToLog + (Number of sensitivity outputs * Number of sensitivity input factors)
names
список регистрируемых состояний и список чувствительности разновидностей, заданных в StatesToLog
относительно входных факторов.
Для примера выхода смотрите Примеры.
Можно добавить много объектов конфигурации модели с различным SensitivityAnalysisOptions
к объекту модели с addconfigset
метод. Только один объект конфигурации модели в объекте модели может иметь Active
набор свойств к true
в любой момент времени.
Inputs | Задайте разновидности и входные факторы параметра для анализа чувствительности |
Normalization | Задайте тип нормализации для анализа чувствительности |
Outputs | Задайте разновидности и параметр выходные параметры для анализа чувствительности |
Применяется | Объект: конфигурация модели |
Тип данных | Объект |
Значения данных | SensitivityAnalysisOptions свойства, как получено в итоге в Сводных данных Свойства. |
Доступ | Только для чтения |
В этом примере показано, как установить SensitivityAnalysisOptions
.
Импортируйте радио-модель затухания из демонстраций SimBiology.
modelObj = sbmlimport('radiodecay');
Получите параметры конфигурации и опции анализа чувствительности от modelObj
.
configsetObj = getconfigset(modelObj);
sensitivityObj = get(configsetObj, 'SensitivityAnalysisOptions');
Добавьте разновидность и параметр к Inputs
свойство. Используйте sbioselect
функция, чтобы получить разновидности и объекты параметра из модели.
speciesObj = sbioselect(modelObj,'Type', 'species', 'Name', 'z'); parameterObj = sbioselect(modelObj, 'Type', 'parameter', 'Name', 'c'); set(sensitivityObj, 'Inputs', [speciesObj parameterObj]);
Добавьте разновидность в Outputs
свойство и отображение.
set(sensitivityObj, 'Outputs', speciesObj); get(sensitivityObj, 'Outputs')
SimBiology Species Array Index: Compartment: Name: InitialAmount: InitialAmountUnits: 1 unnamed z 0 molecule
Включите SensitivityAnalysis
.
set(configsetObj.SolverOptions, 'SensitivityAnalysis', true); get(configsetObj.SolverOptions, 'SensitivityAnalysis') ans = 1
Симулируйте и возвратите результаты к трем выходным переменным. См. Описание для получения дополнительной информации.
[t,x,names] = sbiosimulate(modelObj);
Отобразите names
.
names
names = 'x' 'z' 'd[z]/d[z]_0' 'd[z]/d[Reaction1.c]'
Отобразите значения состояния x
.
x
Отображение следует за порядком следования столбцов, показанным в names
для значений в x
. Строки соответствуют t
.