SimBiology обеспечивает набор интегрированных приложений, которые спроектированы, чтобы упростить создание, симуляцию и анализ моделей динамических систем, таких как количественная системная фармакология (QSP), фармакокинетическая/фармакодинамическая модели системной биологии и (PK/PD).
Приложение SimBiology Model Builder позволяет вам создать динамические модели в интерактивном режиме с помощью различных элементов моделирования. Например, можно смоделировать множество биологических систем, таких как сигнальные трассы, метаболические сети, PBPK, QSP и модели PK/PD. Это также позволяет вам биологическая изменчивость модели и различные режимы дозирования, чтобы исследовать различные экспериментальные условия и стратегии дозирования.
Приложение SimBiology Model Analyzer позволяет вам выполнить исследования моделей динамических систем. Можно симулировать динамическое поведение модели с помощью различных решателей и оценить параметры модели. Чтобы исследовать системную динамику и экспериментирование руководства, можно выполнить развертки параметра и анализ чувствительности.
| SimBiology Model Builder | Создайте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии в интерактивном режиме |
| SimBiology Model Analyzer | Анализируйте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии |
simbio.diagram.getBlock | Получите свойства блока схемы SimBiology |
simbio.diagram.setBlock | Установите свойства блока схемы SimBiology |
simbio.diagram.getLine | Получите свойства линии схемы SimBiology |
simbio.diagram.setLine | Установите свойства линии схемы SimBiology |
simbio.diagram.splitBlock | Разделите блок разновидностей SimBiology в схеме |
simbio.diagram.joinBlock | Объедините все копии блоков разновидностей SimBiology в схеме |
Создайте модель кинетики лиганда приемника
В этом примере показано, как создать и симулировать простую модель кинетики лиганда приемника с помощью приложений SimBiology Model Analyzer и SimBiology Model Builder.
Включите котранспортер глюкозы натрия 2 ингибирования приемника (SGLT2) гипотетическим составным объектом в существующую модель инсулина глюкозы.
Скопируйте и вставьте блоки SimBiology при создавании моделей в Схеме.
Библиотеки компонента модели SimBiology
SimBiology® библиотеки являются наборами встроенных компонентов, которые можно использовать, чтобы создать и анализировать модели.
Передайте значки индикатора в SimBiology Model Builder
Приложение SimBiology Model Builder использует контекстные значки, чтобы предоставить больше информации о компонентах модели в таблицах браузера и блоках во вкладке Diagram.
Отмените и восстановите изменения модели в SimBiology
Можно отменить и восстановить действия, связанные с построением моделей и конфигурирующий свойства блока.
Горячие клавиши для SimBiology Model Builder
Приложение SimBiology Model Builder обеспечивает горячие клавиши для различных действий моделирования.
Сгенерируйте отчет модели SimBiology
Сгенерируйте сообщает содержащий информацию модели.
Выполните неразделенный на отсеки анализ и калибруйте параметры модели путем подбора кривой к экспериментальным данным PKPD с помощью нелинейной регрессии.
Найдите важные параметры с анализом чувствительности Используя приложение SimBiology Model Analyzer
Выполните анализ чувствительности, чтобы найти важные параметры модели.
Сгенерируйте демонстрационные значения для параметров модели, чтобы представлять виртуальных пациентов и симулировать, чтобы исследовать изменчивость модели.
Отсканируйте режимы дозирования Используя приложение SimBiology Model Analyzer
Исследуйте несколько объемов дозирования, которые соответствуют порогам эффективности и токсичности.
Горячие клавиши для SimBiology Model Analyzer
Приложение SimBiology Model Analyzer обеспечивает горячие клавиши для различных аналитических действий.
Сгенерируйте отчет для результатов программы SimBiology
Сгенерируйте отчеты, содержащие результаты анализа из программ.
Визуализируйте экспериментальные данные и статистику симуляции с помощью графика процентили.
