В этом примере показано, как создать и применить вариант к модели белка G деформации дикого типа. Вариант представляет значение параметров для модели белка G деформации мутанта. Таким образом, когда вы симулируете модель, не применяя вариант, вы видите результаты для дикой деформации типа, и когда вы симулируете модель с вариантом, вы видите результаты для деформации мутанта. Этот пример использует модель, описанную в Модели Дрожжей Гетеротримерный Цикл Белка G.
Значение параметра kGd
0.11
для деформации дикого типа и 0.004
для деформации мутанта. Чтобы представлять деформацию мутанта, вы сохраните альтернативное значение 0.004
для kGd
параметр в различном объекте, и применяет этот вариант при симуляции модели.
Для получения информации о вариантах смотрите Варианты в Моделях SimBiology.
Загрузите gprotein.sbproj
проект, который включает переменную m1
, SimBiology® объект модели.
sbioloadproject gprotein
Можно создать вариант исходной модели путем определения различного значения параметров для kGd
параметр модели. Во-первых, добавьте вариант в m1
объект модели.
v1 = addvariant(m1,'mutant_strain');
Затем добавьте параметр kGd
со значением 0.004
к различному объекту v1
.
addcontent(v1,{'parameter','kGd','Value',0.004});
Симулируйте дикую модель типа.
[t,x,names] = sbiosimulate(m1);
Симулируйте модель деформации мутанта путем применения варианта.
[tV,xV,names] = sbiosimulate(m1,v1);
Постройте и сравните симулированные результаты.
subplot(1,2,1) plot(t,x); legend(names); xlabel('Time'); ylabel('Amount'); title('Wild Type'); subplot(1,2,2) plot(tV,xV); legend(names); xlabel('Time'); ylabel('Amount'); title('Mutant Strain');