Можно в интерактивном режиме и программно запустить, остановиться и приостановить отдельные моделирования из Редактора ^Simulink®. Можно просмотреть живые результаты симуляции и взаимодействовать с моделированием в различных способах, включая изменяющиеся настраиваемые параметры. Можно также выйти вперед или назад посредством моделирования и выполнить итеративные моделирования, не перекомпилировав модель.

С программируемым моделированием можно запустить и управлять моделированиями от командной строки ^MATLAB®. Можно также программно включить тайм-ауты моделирования, зафиксировать ошибки моделирования и метаданные моделирования доступа.

Используя несколько API моделирований, можно обеспечить набор входных параметров к модели и запустить несколько моделирований с этими входными параметрами. С функцией parsim можно запустить несколько моделирований параллельно. Это полезно в ситуациях, таких как образцовое тестирование, дизайн экспериментов, анализа Монте-Карло и образцовой оптимизации.