featureNames

Класс: биом. ExpressionSet
Пакет: биом

Получите или определите имена функции в объекте ExpressionSet

Синтаксис

FeatNames = featureNames(ESObj)
FeatNames = featureNames(ESObj, Subset)
NewESObj = featureNames(ESObj, Subset, NewFeatNames)

Описание

FeatNames = featureNames(ESObj) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий все имена функции в объекте ExpressionSet.

FeatNames = featureNames(ESObj, Subset) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий подмножество имена функции в объекте ExpressionSet.

NewESObj = featureNames(ESObj, Subset, NewFeatNames) заменяет имена функции, заданные Subset в ESObj, объекте ExpressionSet, с NewFeatNames, и возвращает NewESObj, новый объект ExpressionSet.

Входные параметры

ESObj

Объект класса bioma.ExpressionSet.

Subset

Одно из следующих, чтобы задать подмножество функции называет в объекте ExpressionSet:

  • Вектор символов или строка, задающая имя функции

  • Массив ячеек из символьных векторов или вектор строки, задающий имена функции

  • Положительное целое число

  • Вектор положительных целых чисел

  • Логический вектор

NewFeatNames

Новая возможность называет для определенных имен функции в объекте ExpressionSet, заданном одним из следующего:

  • Числовой вектор

  • Массив ячеек из символьных векторов или вектор строки

  • Вектор символов или строка, которую featureNames использует в качестве префикса для имен функции с числами функции, добавленными к префиксу

  • Логический true или false (значение по умолчанию). Если true, featureNames присваивает имена уникальной функции с помощью формата Feature1, Feature2, и т.д.

Количество имен функции в NewFeatNames должно равняться количеству функций, заданных Subset.

Выходные аргументы

FeatNames

Массив ячеек из символьных векторов, задающий все или часть функции, называет в объекте ExpressionSet. Имена функции являются именами строки в объектах DataMatrix в объекте ExpressionSet. Имена функции являются также именами строки массива набора данных VarValues в объекте MetaData в объекте ExpressionSet.

NewESObj

Объект класса bioma.ExpressionSet, возвращенного после заменяющий определенные имена функции.