sampleNames

Класс: биом. ExpressionSet
Пакет: биом

Получите или определите демонстрационные имена в объекте ExpressionSet

Синтаксис

SamNames = sampleNames(ESObj)
SamNames = sampleNames(ESObj, Subset)
NewESObj = sampleNames(ESObj, Subset, NewSamNames)

Описание

SamNames = sampleNames(ESObj) возвращает массив ячеек строк, задающих все демонстрационные имена в объекте ExpressionSet.

SamNames = sampleNames(ESObj, Subset) возвращает массив ячеек строк, задающих подмножество демонстрационные имена в объекте ExpressionSet.

NewESObj = sampleNames(ESObj, Subset, NewSamNames) заменяет демонстрационные имена, заданные Subset в ESObj, объекте ExpressionSet, с NewSamNames, и возвращает NewESObj, новый объект ExpressionSet.

Входные параметры

ESObj

Объект класса bioma.ExpressionSet.

Subset

Одно из следующих, чтобы задать подмножество выборки называет в объекте ExpressionSet:

  • Строка или вектор символов, задающий демонстрационное имя

  • Массив ячеек из символьных векторов или вектор строки, задающий демонстрационные имена

  • Положительное целое число

  • Вектор положительных целых чисел

  • Логический вектор

NewSamNames

Новая выборка называет для определенных демонстрационных имен в объекте ExpressionSet, заданном одним из следующего:

  • Числовой вектор

  • Массив ячеек из символьных векторов или вектор строки

  • Вектор символов или строка, которую sampleNames использует в качестве префикса для демонстрационных имен с демонстрационными числами, добавленными к префиксу

  • Логический true или false (значение по умолчанию). Если true, sampleNames присваивает уникальные демонстрационные имена с помощью формата Sample1, Sample2, и т.д.

Количество демонстрационных имен в NewSamNames должно равняться количеству выборок, заданных Subset.

Выходные аргументы

SamNames

Массив ячеек строк, задающих все или часть выборки, называет в объекте ExpressionSet. Демонстрационные имена являются именами столбцов в объектах DataMatrix в объекте ExpressionSet. Демонстрационные имена являются также именами строки массива набора данных VarValues в объекте MetaData в объекте ExpressionSet.

NewESObj

Объект класса bioma.ExpressionSet, возвращенного после заменяющий определенные демонстрационные имена.

Примеры

Создайте объект ExpressionSet, ESObj, как описано в разделе Examples страницы ссылки класса bioma.ExpressionSet. Получите демонстрационные имена из него:

% Retrieve the sample names 
SNames = sampleNames(ESObj);

Смотрите также

| | | |

Темы

Документация Bioinformatics Toolbox
Поддержка
Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте