Импорт данных и управление
Функции
affyread | Считайте микроданные массива из файла Affymetrix GeneChip |
affysnpannotread | Данные массива DNA Рида Аффиметрикса Мэппинга из файла аннотации формата CSV |
affyprobeseqread | Считайте файл данных, содержащий тестовую информацию о последовательности для массива Affymetrix GeneChip |
celintensityread | Считайте тестовую интенсивность из файлов Affymetrix CEL |
getgeodata | Получите данные о формате Автобуса экспрессии гена (GEO) |
geoseriesread | Считайте Ряд Автобуса экспрессии гена (GEO) (GSE) данные о формате |
geosoftread | Считайте Автобус экспрессии гена (GEO) данные о формате SOFT |
galread | Считайте микроданные массива из файла списка массива GenePix |
gprread | Считайте микроданные массива из Результатов GenePix (GPR) файл |
agferead | Программный файл Выделения признаков Рида Аджилента |
ilmnbsread | Считайте данные об экспрессии гена, экспортированные из программного обеспечения Illumina BeadStudio |
imageneread | Считайте микроданные массива из файла Результатов ImaGene |
sptread | Считайте данные из файла SPOT |
goannotread | Читайте аннотации от Джина Онтолоджи аннотировали файл |
cytobandread | Считайте цитогенетические информации соединения |
Классы
bioma.ExpressionSet | Содержите данные из эксперимента экспрессии гена микромассивов |
bioma.data.ExptData | Содержите значения данных из эксперимента микромассивов |
bioma.data.MetaData | Содержите метаданные из эксперимента микромассивов |
bioma.data.MIAME | Содержите информацию об эксперименте из эксперимента экспрессии гена микромассивов |
Примеры и руководства
Данные об экспрессии гена управления в объектах
Обзор объектов для Данных об Экспрессии гена Микромассивов
Представление значений данных выражения в объектах DataMatrix
Создайте объекты DataMatrix, получите и установите свойства и данные о доступе.
Представление значений данных выражения в объектах ExptData
Создайте объекты ExptData, используйте свойства и методы и данные о доступе.
Представление метаданных выборки и функции в объектах MetaData
Создайте объекты MetaData, используйте свойства и методы и данные о доступе.
Представление информации об эксперименте в объекте MIAME
Создайте объекты MIAME, используйте свойства и методы и данные о доступе.
Представление всех данных в объекте ExpressionSet
Создайте объекты ExpressionSet, используйте свойства и методы и данные о доступе.
Визуализация изображений микромассивов
Создайте фигуры, чтобы визуализировать микроданные массива и подготовить данные к анализу.
Exchange Bioinformatics Data Between Excel и MATLAB
Пример использования Spreadsheet Link™ с программным обеспечением, чтобы просмотреть биоинформатические данные
Концепции
Устройство хранения данных микроданных массива
Bioinformatics Toolbox™ включает функции, объекты и методы для создания, хранения и доступа к микроданным массива.
Доступ к онлайновым базам данных и репозиториям с помощью различных функций MATLAB® и импортирует данные к рабочей области для последующих анализов.
