Exponenta Banner

getInfo

Класс: BioMap

Получите информацию для одного элемента объекта BioMap

Синтаксис

Info = getInfo(BioObj, Element)

Описание

Info = getInfo(BioObj, Element) возвращает Info, разграниченный вкладкой вектор символов, содержащий информацию об одном элементе в BioObj, объекте BioMap.

Входные параметры

BioObj

Объект класса BioMap.

Element

Одно из следующих, чтобы указать один элемент в BioObj:

  • Скаляр, задающий индекс элемента

  • Логический вектор

  • Вектор символов, содержащий допустимый заголовок последовательности

Выходные аргументы

Info

Разграниченный вкладкой вектор символов, содержащий информацию об одном элементе в BioObj, объекте BioMap. Вектор символов содержит информацию из следующих свойств по порядку:

  • Header

  • Flag

  • Start

  • MappingQuality

  • Signature

  • Sequence

  • Quality

Примеры

Создайте объект BioMap, и затем получите информацию для второго элемента в объекте:

% Construct a BioMap object from a SAM file 
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve information for the second element in the object
element2Info = getInfo(BMObj1, 2)
element2Info =

EAS54_65:7:152:368:113	73	3	99	35M	
CTAGTGGCTCATTGTAAATGTGTGGTTTAACTCGT	
<<<<<<<<<<0<<<<655<<7<<<:9<<3/:<6):

Смотрите также

Темы

Внешние веб-сайты

Документация Bioinformatics Toolbox
Поддержка