Упорядочивание высокой пропускной способности
Экспрессия гена, транскрипционный фактор и анализ метилирования данных об Упорядочивании следующего поколения (NGS), включая RNA-Seq и ЧИП-Seq
Методы упорядочивания высокой пропускной способности генерируют большие суммы данных о последовательности и требуют устойчивых вычислительных аппаратов для последующего анализа. Bioinformatics Toolbox™ предоставляет алгоритмы, чтобы поддержать общие аналитические рабочие процессы для данных об Упорядочивании следующего поколения (NGS), такие как фильтрация и обрезка чтений, отображение чтений к ссылкам, подсчет количества чтений, сопоставленных с геномными функциями и выполнением статистических анализов.
Подсвеченные темы
- Импорт данных
Импортируйте данные об Упорядочивании следующего поколения (NGS) и покажите аннотации от СЭМА, BAM, FASTA, FASTQ, GTF и файлов GFF
- Предварительная обработка
Управляйте данными NGS с синглом - и чтения парного конца, фильтр и обрежьте чтения и качественную статистику отображения
- Выравнивание
Сопоставьте чтения со ссылочной последовательностью (последовательностями)
- Статистический анализ
Считайте резюмирование и статистические анализы данных ЧИПА-seq и RNA-seq
- Визуализация
Визуализируйте выравнивание чтений к ссылочным последовательностям
