Класс: BioMap
Установите последовательность, сопоставляющую качественную музыку к объекту BioMap
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality)
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality, Subset)
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality)NewObj, новый объект BioMap, созданный из BioObj, существующего объекта BioMap, с набором свойств MappingQuality к MappingQuality, вектору целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения.
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality, Subset)NewObj, новый объект BioMap, созданный из BioObj, существующего объекта BioMap, со свойством MappingQuality подмножества набора элементов к MappingQuality, вектору целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения. Это устанавливает качественную музыку отображения только к объектным элементам, указанным Subset.
|
Объект класса ПримечаниеЕсли |
|
Вектор целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения. |
|
Одно из следующих, чтобы задать подмножество элементов в
ПримечаниеНепосредственное отношение должно существовать между номером и порядком элементов в |
|
Объект класса |
Создайте объект BioMap, и затем установите подмножество качественных очков отображения:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Set the Mapping Quality property of the second element to a new
% value
BMObj1 = setMappingQuality(BMObj1, 74, 2);Чтобы обновить качественные очки отображения в существующем объекте BioMap, используйте тот же объект в качестве входа BioObj и вывода NewObj.
Альтернатива использованию метода setMappingQuality, чтобы обновить существующий объект должна использовать точечную индексацию со свойством MappingQuality:
BioObj.MappingQuality(Indices) = NewMappingQuality
В предыдущем синтаксисе Indices является вектором положительных целых чисел или логическим вектором. Indices не может быть массивом ячеек из символьных векторов, содержащим заголовки последовательности. NewMappingQuality является вектором целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения. Indices и NewQuality должны иметь тот же номер и порядок элементов.