Exponenta Banner

getFeatureNames

Класс: GFFAnnotation

Получите имена уникальной функции из объекта GFFAnnotation

Синтаксис

Features = getFeatureNames(AnnotObj)

Описание

Features = getFeatureNames(AnnotObj) возвращает Features, массив ячеек из символьных векторов, задающий имена уникальной функции, сопоставленные с аннотациями в AnnotObj.

Входные параметры

AnnotObj

Объект класса GFFAnnotation.

Выходные аргументы

Features

Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена уникальной функции, сопоставлен с аннотациями в AnnotObj.

Примеры

Создайте объект GFFAnnotation из GFF-отформатированного файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем получите имена функции из объекта аннотации:

% Construct a GFFAnnotation object from a GFF file
GFFAnnotObj = GFFAnnotation('tair8_1.gff');
% Retrieve feature names for the annotation object
featureNames = getFeatureNames(GFFAnnotObj)

featureNames = 

    'CDS'
    'exon'
    'five_prime_UTR'
    'gene'
    'mRNA'
    'miRNA'
    'ncRNA'
    'protein'
    'pseudogene'
    'pseudogenic_exon'
    'pseudogenic_transcript'
    'tRNA'
    'three_prime_UTR'
    'transposable_element_gene'

Смотрите также

Темы

Внешние веб-сайты

Документация Bioinformatics Toolbox
Поддержка