Exponenta Banner

niftiread

Считайте изображение NIfTI

свернуть все на странице

Синтаксис

V = niftiread(filename)
V = niftiread(headerfile,imgfile)
V = niftiread(info)

Описание

пример

V = niftiread(filename) читает файл изображения NIfTI, заданный filename, в текущей папке или на пути, и возвращает объемные данные в V.

NIfTI (Нейроотображающий Технологическую Инициативу Информатики) является NIH-спонсируемой рабочей группой, чтобы способствовать функциональной совместимости функциональных программных инструментов нейрообработки изображений. NIfTI использует один или двойной формат хранилища файлов. Двойной формат хранит данные в паре файлов: заголовочный файл (.hdr), содержащий метаданные и файл данных (.img). Один формат файла хранит данные в одном файле (.nii), который содержит информацию о заголовке, сопровождаемую данными.

V = niftiread(headerfile,imgfile) читает заголовочный файл NIfTI (.hdr) и файл изображения (.img) пара.

пример

V = niftiread(info) читает файл NIfTI, описанный структурой метаданных info. Чтобы создать структуру info, используйте функцию niftiinfo

Примеры

свернуть все

Скрипт Open Live Script

Загрузите объемные данные из файла NIfTI. Файл использует объединенный формат NIfTI - изображение и метаданные находятся в том же файле. Этот тип файла NIfTI имеет .nii расширение файла.

V = niftiread('brain.nii');

Просмотрите переменную в рабочей области.

whos V
  Name        Size                  Bytes  Class    Attributes

  V         256x256x21            1376256  uint8
Скрипт Open Live Script

Считайте метаданные из файла NIfTI. 

info = niftiinfo('brain.nii');

Считайте объемное изображение с помощью структуры метаданных, возвращенной niftiinfo.

V = niftiread(info);

Просмотрите переменную в рабочей области.

whos V
  Name        Size                  Bytes  Class    Attributes

  V         256x256x21            1376256  uint8

Входные параметры

свернуть все

Имя файла NIfTI, заданного как скаляр строки или вектор символов. Если вы не задаете расширение файла, niftiread ищет файл с расширением .nii. Если niftiread не может найти файл с тем расширением, он ищет gzipped версию файла с дополнительным .nii.gz. Если niftiread не может найти файл с тем расширением, он ищет файл с .hdr, .hdr.gz, .img или расширением файла .img.gz. Если niftiread не может найти файл, который совпадает с любой из этих опций, он возвращает ошибку.

Типы данных: char | string

Имя файла, содержащего метаданные, заданные как скаляр строки или вектор символов. Заголовочный файл NIfTI (.hdr) содержит метаданные, сопоставленные с объемом NIfTI. Если вы не задаете соответствующий imgfile, то niftiread смотрит в той же папке для файла с тем же именем и дополнительным .img.

Типы данных: char | string

Имя файла, содержащего объем, заданный как скаляр строки или вектор символов. Файл изображения NIfTI (.img) содержит данные об объеме. Если вы не задаете соответствующий заголовочный файл, niftiread смотрит в той же папке для файла с тем же именем и дополнительным .hdr.

Типы данных: char | string

Метаданные файла NIfTI, заданные как структура, возвращенная niftiinfo.

Типы данных: struct

Примечание

Функция niftiread поддерживает и NIfTI1 и форматы файлов NIfTI2.

Выходные аргументы

свернуть все

Объемные данные, возвращенные как числовой массив.

Ссылки

[1] Cox, R. W. Дж. Ашбернер, Х. Бремен, К. Фисселл, К. Хэзелгроув, К.Дж. Холмс, Дж.Л. Ланкастер, Д. Рекс, С.М. Смит, Дж.Б. Вудвард, и Южная Каролина Strother. '(Вид) новый стандарт формата данных изображения: Nifti-1. "Нейроизображение, Издание 22 (Suppl 1): e1440, 2004.

Смотрите также

|

Введенный в R2017b

Документация Image Processing Toolbox
Поддержка