getsensmatrix (SimData)

Получите 3-D матрицу чувствительности от массива SimData

Синтаксис

[T, R, Outputs, InputFactors] = getsensmatrix(simDataObj) [T, R, Outputs, InputFactors] = getsensmatrix(simDataObj,OutputNames,InputFactorNames)

Аргументы

`T`	`T` является определением `m-by-1` массивов моменты времени для данных о чувствительности в R.
`R`	`R` является массивом `m-by-n-by-p` данных о чувствительности с временами, выходными параметрами и входными факторами, соответствующими его первым, вторым, и третьим размерностям соответственно. `R(:,i,j)` является курсом времени для чувствительности `Outputs{i}` состояния `к входному фактору InputFactors{j}.`
`Outputs`	Имя выходных факторов, где выведенными факторами являются имена состояний, для которых вы хотите вычислить чувствительность.
`InputFactors`	Имя входных факторов, где введенными факторами являются имена состояний, относительно которых вы хотите вычислить чувствительность.

Описание

[T, R, Outputs, InputFactors] = getsensmatrix(simDataObj) получает время и данные о чувствительности из объекта SimData (simDataObj).

Когда simDataObj содержит больше чем один элемент, выходными аргументами являются массивы ячеек, в которых каждая ячейка содержит данные для соответствующего элемента simDataObj.

Метод getsensmatrix может только возвратить данные о чувствительности, которые содержатся в объекте SimData. Данные о чувствительности, которые зарегистрированы объект SimData, установлены во времени симуляции конфигурацией модели, используемой во время симуляции. Это обычно - активная конфигурация модели модели. Для объяснения того, как настроить вычисление чувствительности с помощью конфигурации модели, см. “Анализ чувствительности”. Обратите внимание в частности, что данные о чувствительности R, возвращенный getsensmatrix, могут быть нормированы, как задано во времени симуляции.

[T, R, Outputs, InputFactors] = getsensmatrix(simDataObj,OutputNames,InputFactorNames) получает данные о чувствительности для выходных параметров, заданных OutputNames и входными факторами, заданными InputFactorNames.

OutputNames и InputFactorNames могут оба быть любым из следующего:

Пустой массив
Вектор символов или скалярная строка, задающая имя
Вектор строки или массив ячеек из символьных векторов, задающий несколько имен

Передайте пустой массив для OutputNames или InputFactorNames, чтобы попросить данные о чувствительности по всем выходным факторам или ввести факторы, содержавшиеся в simDataObj, соответственно. Можно также использовать полностью определенные имена, такие как 'CompartmentName.SpeciesName' или 'ReactionName.ParameterName', чтобы разрешить неоднозначности.

Примеры

Этот пример показывает, как получить данные о чувствительности от объекта SimData.

Настройте симуляцию:
1. Импортируйте радио-модель затухания из примеров SimBiology^®.
```
modelObj  = sbmlimport('radiodecay');
```
2. Получите параметры конфигурации и опции анализа чувствительности от modelObj.
```
configsetObj = getconfigset(modelObj);
sensitivityObj = get(configsetObj, 'SensitivityAnalysisOptions');
```
3. Задайте разновидности, для которых вы хотите данные о чувствительности в свойстве Outputs. Все образцовые разновидности выбраны в этом примере. Используйте функцию sbioselect, чтобы получить объекты разновидностей из модели.
```
allSpeciesObj = sbioselect(modelObj, 'Type', 'species');
set(sensitivityObj, 'Outputs', allSpeciesObj);
```
4. Задайте разновидности и параметры, относительно которых вы хотите вычислить чувствительность в свойстве Inputs.
```
speciesObj = sbioselect(modelObj,'Type', 'species', 'Name', 'z');
parameterObj = sbioselect(modelObj, 'Type', 'parameter', 'Name', 'c');
set(configsetObj.SensitivityAnalysisOptions,'Inputs', [speciesObj, parameterObj]);
```
5. Включите SensitivityAnalysis.
```
set(configsetObj.SolverOptions, 'SensitivityAnalysis', true)
get(configsetObj.SolverOptions, 'SensitivityAnalysis')

ans =

  1
```
6. Моделируйте и возвратите результаты в объекте SimData.
```
simDataObj = sbiosimulate(modelObj)
```
Извлеките и отобразите данные о чувствительности на графике из объекта SimData.
1. Используйте getsensmatrix, чтобы получить данные о чувствительности.
```
[t R outs ifacs] = getsensmatrix(simDataObj);
```
2. Постройте значения чувствительности.
```
plot(t, R(:,:,2));
legend(outs);
title(['Sensitivities of species relative to ' ifacs{2}]);
```

Функция MATLAB^® struct

Документация

getsensmatrix (SimData)

Синтаксис

Аргументы

Описание

Примеры

Смотрите также

Представленный в R2007b

Документация SimBiology

Поддержка