Задайте опции анализа чувствительности
Свойство SensitivityAnalysisOptions
является объектом, который содержит опции анализа чувствительности в объекте конфигурации модели. Анализ чувствительности поддерживается только для детерминированного (ОДУ) симуляции.
Свойство SensitivityAnalysisOptions
управляет настройками, связанными с анализом чувствительности. Чтобы включить или отключить анализ чувствительности, используйте свойство SensitivityAnalysis
.
Свойства SensitivityAnalysisOptions
получены в итоге в Сводных данных Свойства.
Когда анализ чувствительности включен, следующая команда
[t,x,names] = sbiosimulate(modelObj)
возвращает [t,x,names]
, где
t
является вектором n-by-1
, где n
является количеством шагов, сделанных решателем оды, и t
задает временные шаги решателя.
x
является матрицей n-by-m
, где n
является количеством шагов, сделанных решателем оды, и m
:
Number of species and parameters specified in StatesToLog + (Number of sensitivity outputs * Number of sensitivity input factors)
names
является списком регистрируемых состояний и списком чувствительности разновидностей, заданных в StatesToLog
относительно входных факторов.
Для примера вывода смотрите Примеры.
Можно добавить много объектов конфигурации модели с различным SensitivityAnalysisOptions
к объекту модели с методом addconfigset
. Только один объект конфигурации модели в объекте модели может иметь набор свойств Active
к true
в любой момент времени.
Входные параметры | Задайте разновидности и входные факторы параметра для анализа чувствительности |
Нормализация | Задайте тип нормализации для анализа чувствительности |
Выходные параметры | Задайте разновидности и параметр выходные параметры для анализа чувствительности |
Применяется | Объект: конфигурация модели |
Тип данных | Объект |
Значения данных | Свойства SensitivityAnalysisOptions , как получено в итоге в Сводных данных Свойства. |
Доступ | Только для чтения |
Этот пример показывает, как установить SensitivityAnalysisOptions
.
Импортируйте радио-модель затухания из демонстраций SimBiology.
modelObj = sbmlimport('radiodecay');
Получите параметры конфигурации и опции анализа чувствительности от modelObj
.
configsetObj = getconfigset(modelObj);
sensitivityObj = get(configsetObj, 'SensitivityAnalysisOptions');
Добавьте разновидность и параметр к свойству Inputs
. Используйте функцию sbioselect
, чтобы получить разновидности и объекты параметра из модели.
speciesObj = sbioselect(modelObj,'Type', 'species', 'Name', 'z'); parameterObj = sbioselect(modelObj, 'Type', 'parameter', 'Name', 'c'); set(sensitivityObj, 'Inputs', [speciesObj parameterObj]);
Добавьте разновидность в свойство Outputs
и отображение.
set(sensitivityObj, 'Outputs', speciesObj); get(sensitivityObj, 'Outputs')
SimBiology Species Array Index: Compartment: Name: InitialAmount: InitialAmountUnits: 1 unnamed z 0 molecule
Включите SensitivityAnalysis
.
set(configsetObj.SolverOptions, 'SensitivityAnalysis', true); get(configsetObj.SolverOptions, 'SensitivityAnalysis') ans = 1
Моделируйте и возвратите результаты в три выходных переменные. См. Описание для получения дополнительной информации.
[t,x,names] = sbiosimulate(modelObj);
Отобразите names
.
names
names = 'x' 'z' 'd[z]/d[z]_0' 'd[z]/d[Reaction1.c]'
Отобразите значения состояния x
.
x
Отображение следует за порядком следования столбцов, показанным в names
для значений в x
. Строки соответствуют t
.