Филогенетический анализ

Восстановите, просмотрите, взаимодействуйте с и отредактируйте филогенетические деревья; загрузите методы для оценки уверенности; синонимичный и несинонимичный анализ

Приложения

Phylogenetic TreeВизуализируйте, отредактируйте и исследуйте филогенетические древовидные данные

Функции

seqlinkageСоздайте филогенетическое дерево из попарных расстояний
seqneighjoinСоздайте филогенетическое дерево с помощью соединяющего соседа метода
seqpdistВычислите попарное расстояние между последовательностями
phytreeviewerВизуализируйте, отредактируйте и исследуйте филогенетические древовидные данные
dndsОцените синонимичные и несинонимичные уровни замены
dndsmlОцените синонимичные и несинонимичные уровни замены с помощью метода максимального правдоподобия
gethmmtreeПолучите филогенетические древовидные данные от базы данных PFAM
seqinsertgapsВставьте разрывы в нуклеотид или последовательность аминокислот

Классы

phytreeСоздайте объект phytree
phytree objectСтруктура данных, содержащая филогенетическое дерево

Темы

Филогенетический анализ

Филогенетический анализ является процессом, который вы используете, чтобы определить эволюционные отношения между организмами.

Используя приложение Phylogenetic Tree

Описание команд меню и функций создания пригодных для печати древовидных фигур.

Утилиты последовательности и статистика

Можно управлять и анализировать последовательности, чтобы получить более глубокое понимание физических, химических, и биологических характеристик данных.

Рекомендуемые примеры

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте