Выберите данные из объекта SimData
[t,x,names] =
select(simDataObj, Query)
[Out] = select(simDataObj, Query,
'Format', 'FormatValue')
| n-by-1 вектор моментов времени. |
| n-by-m массив данных. t и names пометьте строки и столбцы x соответственно. |
| An m-by-1 массив ячеек имен. |
| Данные, возвращенные в формате, заданы в ', показанный во Входных параметрах. В зависимости от заданного ', Out содержит одно из следующего:
|
| Объектный массив SimData. Введите имя переменной для объекта SimData. |
| Массив ячеек аргументов, состоящих из некоторой комбинации имени свойства / пары значения свойства и/или 'Where' пункты. Для большего количества полного описания синтаксиса запроса, включая 'Where' пункты и их поддерживаемые типы условия, смотрите sbioselect. Можно использовать любое из полей метаданных, доступных в ячейках DataInfo свойство объекта SimData в запросе. Они включают 'Type'ИмяМодули, 'Compartment' (только разновидности), или 'Reaction' (только параметр). |
| Выберите формат из следующей таблицы. |
| FormatValue | Описание |
|---|---|
'num' | Задает формат, который позволяет вам возвратить данные в числовых массивах. Это - значение по умолчанию когда select вызван несколькими выходными аргументами. |
'nummetadata' | Задает формат, который позволяет вам возвратить массив ячеек структур метаданных в |
'numqualnames' | Задает формат, который позволяет вам возвратить полностью определенные имена в |
'struct' | Задает формат, который позволяет вам возвратить массив структур, содержащий и данные и метаданные. Это - значение по умолчанию, когда вы используете один выходной аргумент. |
'simdata' | Задает формат, который позволяет вам возвратить данные в новом объекте SimData. Это - формат по умолчанию когда select вызван нулем или одним выходным аргументом. |
'ts' | Задает формат, который позволяет вам возвратить данные в объектах временных рядов, создавая отдельные временные ряды для каждого состояния или столбца и объекта SimData в simDataObj. |
'tslumped' | Задает формат, который позволяет вам возвратить данные в объектах временных рядов, комбинируя данные из каждого объекта SimData в одни временные ряды. |
[ возвращает время симуляции и данные состояния из объекта SimData (t,x,names] =
select(simDataObj, Query)simDataObj) это совпадает с аргументом Query
В объекте SimData simDataObjsimDataObj.Data помечены массивом ячеек структур метаданных, данных simDataObj.DataInfo. select метод позволяет вам выбрать столбцы матрицы данных на основе их меток метаданных. Например, извлечь данные для всех параметров вошло в систему объект SimData simDataObj[.t, x, names] = выбор (simDataObj, {'Тип', 'параметр'}])
[ возвращает данные в заданном формате. Допустимые форматы перечислены во Входных параметрах.Out] = select(simDataObj, Query,
'Format', 'FormatValue')
В этом примере показано, как извлечь данные интереса от ваших данных моделирования с select метод.
Файл проекта radiodecay.sbproj содержит модель, сохраненную в переменной под названием m1. Загрузите m1 в рабочую область MATLAB®.
sbioloadproject gprotein_norules m1
Измените решатель, чтобы использовать во время симуляции и выполнить запущенный ансамбль.
csObj = getconfigset(m1); set(csObj, 'SolverType', 'ssa'); simDataObj = sbioensemblerun(m1, 10);
Выберите все данные о разновидностях, вошел в систему массив SimData sdarray.
[t x n] = select(simDataObj, {'Type','species'});Выберите данные для параметров с именем 'Kd' и возвратите результаты в новом объектном массиве SimData.
newsd = select(simDataObj, {'Type','parameter','name', 'Kd'});Это выбирает все данные из simDataObj с именем, которое совпадает с шаблоном 'G' и возвращает объекты временных рядов.
ts = select(simDataObj, {'Where','Name','regexp','G'}, ...
'Format','ts');getdata, sbioselect, sbiosimulate, selectbyname, Simdata object