exponenta event banner

SimBiology

Создайте PK/PD и механистические модели системной биологии в интерактивном режиме

Описание

Приложение SimBiology позволяет вам создать модели динамических систем, такие как количественная системная фармакология (QSP), фармакокинетическая/фармакодинамическая (PK/PD) и модели системной биологии в интерактивном режиме. Это предоставляет редактор блок-схемы, чтобы создать реакцию модели, схематичную при помощи встроенных блоков.

Используя приложение, вы можете:

  • Создайте множество динамических систем, таких как метаболические сети, сигнальные трассы, QSP, PBPK и модели PK/PD.

  • Создайте стандартные разделенные на отсеки модели PK из встроенной библиотеки.

  • Просмотрите свою модель в форме математических уравнений с помощью Представления уравнений или просмотрите графическое представление с помощью представления Diagram.

  • Используйте варианты, чтобы сохранить набор значений параметров или начальных условий, которые отличаются от настройки базовой модели.

  • Создайте массив доз, чтобы исследовать различные режимы дозирования.

  • Импортируйте или экспортируйте модели SimBiology в и из рабочей области MATLAB® или из файла Языка разметки системной биологии (SBML).

Откройте приложение SimBiology

  • Панель инструментов MATLAB: На вкладке Apps, под Computational Biology, кликают по значку приложения.

  • Командная строка MATLAB: Введите simbiology.

Программируемое использование

развернуть все

simbiology открывает рабочий стол SimBiology.

simbiology(model) открывает приложение с model SimBiology. Можно внести изменения в model в приложении или в командной строке. Поскольку и командная строка и приложение указывают на тот же объект модели, изменения, которые вы вносите в модель в приложении, отражаются в командной строке или наоборот. Если у вас есть приложение SimBiology Model Analyzer, открытое одновременно, изменения модели отражаются там также.

simbiology(file) открывает файл проекта, заданный file в приложении. file строка или вектор символов, задающий имя файла или путь и имя файла проекта SimBiology sbproj файл. Если вы задаете только имя файла, файл должен быть на пути поиска файлов MATLAB или в текущей папке.

Введенный в R2019b