Класс: BioMap
Установите последовательность, сопоставляющую качественную музыку к BioMap объект
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality)
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality, Subset)
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality)NewObj, новый BioMap объект, созданный из BioObj, существующий BioMap объект, с MappingQuality набор свойств к MappingQuality, вектор целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения.
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality, Subset)NewObj, новый BioMap объект, созданный из BioObj, существующий BioMap объект, с MappingQuality свойство подмножества набора элементов к MappingQuality, вектор целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения. Это устанавливает качественную музыку отображения только к объектным элементам, указанным Subset.
|
Объект ПримечаниеЕсли |
|
Вектор целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения. |
|
Одно из следующих, чтобы задать подмножество элементов в
ПримечаниеНепосредственное отношение должно существовать между номером и порядком элементов в |
|
Объект |
Создайте BioMap объект, и затем набор подмножество качественных баллов отображения:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Set the Mapping Quality property of the second element to a new
% value
BMObj1 = setMappingQuality(BMObj1, 74, 2);Обновить качественные баллы отображения в существующем BioMap объект, используйте тот же объект в качестве входа BioObj и выход NewObj.
Альтернатива использованию setMappingQuality метод, чтобы обновить существующий объект должен использовать точечную индексацию с MappingQuality свойство:
BioObj.MappingQuality(Indices) = NewMappingQuality
В предыдущем синтаксисе, Indices вектор положительных целых чисел или логический вектор. Indices не может быть массив ячеек из символьных векторов, содержащий заголовки последовательности. NewMappingQuality вектор целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения. Indices и NewQuality должен иметь тот же номер и порядок элементов.