Возвратите матрицу оценок Gonnet
gonnet
gonnet возвращает матрицу Gonnet.
Матрица Gonnet является рекомендуемой матрицей мутации для того, чтобы первоначально выровнять последовательности белка. Элементы матрицы являются десять раз логарифмической из вероятности, что остатки выравниваются разделенные на вероятность, что остатки выравниваются случайно, и затем элементы матрицы нормированы к 250 модулям PAM.
Ожидаемый счет = -0.6152, Энтропия = 1.6845 биты, Самый Низкий счет = -8, Самый высокий счет = 14.2
Порядок:
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X *
[1] Гастон, H., Gonnet, M., Коэн, A. и Benner, S. (1992). Исчерпывающее соответствие целой базы данных последовательности белка. Наука. 256, 1443–1445.