Считайте 2D полутоновое изображение в рабочую область.

m = dicominfo('knee1.dcm');
A = dicomread(m);

Создайте imref2d объект, задавая размер и разрешение пикселей. Файл DICOM содержит поле метаданных PixelSpacing это задает разрешение изображения в каждой размерности в миллиметрах на пиксель.

RA = imref2d(size(A),m.PixelSpacing(2),m.PixelSpacing(1))

RA = 
  imref2d with properties:

           XWorldLimits: [0.1562 160.1562]
           YWorldLimits: [0.1562 160.1562]
              ImageSize: [512 512]
    PixelExtentInWorldX: 0.3125
    PixelExtentInWorldY: 0.3125
    ImageExtentInWorldX: 160
    ImageExtentInWorldY: 160
       XIntrinsicLimits: [0.5000 512.5000]
       YIntrinsicLimits: [0.5000 512.5000]

Отобразите изображение, не использовав пространственный объект привязки. Координаты осей отражают внутренние координаты. Заметьте, что координата (0,0) находится в левом верхнем углу.

figure
imshow(A,'DisplayRange',[0 512])
axis on

Предположим, что вы хотите вычислить аппроксимированное положение и ширину колена в миллиметрах. Выберите конечные точки линейного сегмента, который запускается горизонтально через колено на уровне коленной чашечки. Например, используйте (x, y) точки (34,172) и (442,172).

xIntrinsic = [34 442];
yIntrinsic = [172 172];

Преобразуйте эти точки от внутренних координат до мировых координат.

[xWorld,yWorld] = intrinsicToWorld(RA,xIntrinsic,yIntrinsic)

xWorld = 1×2

   10.6250  138.1250

yWorld = 1×2

   53.7500   53.7500

Мировые координаты двух точек (10.625,53.75) и (138.125,53.75) в модулях миллиметров. Аппроксимированная ширина колена в миллиметрах:

width = xWorld(2) - xWorld(1)

width = 127.5000

Считайте 3-D объем в рабочую область. Это изображение состоит из 27 систем координат 128 128 пиксельных изображений.

load mri;
D = squeeze(D);
D = ind2gray(D,map);

Создайте imref3d пространственный объект привязки сопоставлен с объемом. В иллюстративных целях обеспечьте пиксельное разрешение в каждой размерности. Разрешение находится в миллиметрах на пиксель.

R = imref3d(size(D),2,2,4)

R = 
  imref3d with properties:

           XWorldLimits: [1 257]
           YWorldLimits: [1 257]
           ZWorldLimits: [2 110]
              ImageSize: [128 128 27]
    PixelExtentInWorldX: 2
    PixelExtentInWorldY: 2
    PixelExtentInWorldZ: 4
    ImageExtentInWorldX: 256
    ImageExtentInWorldY: 256
    ImageExtentInWorldZ: 108
       XIntrinsicLimits: [0.5000 128.5000]
       YIntrinsicLimits: [0.5000 128.5000]
       ZIntrinsicLimits: [0.5000 27.5000]

Отобразите средний срез объема, не использовав пространственный объект привязки. Координаты осей отражают внутренние координаты. Заметьте, что координата (0,0) находится в левом верхнем углу этой плоскости. z=0 является правильным ниже первого среза, и ось z положительна в восходящем направлении к короне головы.

figure
imshow(D(:,:,13))
axis on

Предположим, что вы хотите определить положение, в миллиметрах, функций в этом срезе. Выберите четыре точки выборки и сохраните их внутренние координаты в векторах. Например, первая точка имеет внутренние координаты (54,46,13). Внутренняя z-координата является тем же самым для всех точек в этом срезе.

xI = [54 71 57 70];
yI = [46 48 79 80];
zI = [13 13 13 13];

Преобразуйте внутренние координаты в мировые координаты с помощью intrinsicToWorld.

[xW,yW,zW] = intrinsicToWorld(R,xI,yI,zI)

xW = 1×4

   108   142   114   140

yW = 1×4

    92    96   158   160

zW = 1×4

    52    52    52    52

Итоговые векторы являются миром x-, y-, и z-координатами, в миллиметрах, выбранных точек. Первая точка, например, возмещена от источника на 108 мм в направлении X, 92 мм в направлении Y и 52 мм в z-направлении.