logp
Логарифмические вероятности документа и качество подгонки модели LDA
Синтаксис
Описание
___ = logp(___, задает дополнительные опции с помощью одного или нескольких аргументов пары "имя-значение".Name,Value)
Примеры
Вычислите логарифмические вероятности документа
Чтобы воспроизвести результаты в этом примере, установите rng к 'default'.
rng('default')Загрузите данные в качестве примера. Файл sonnetsPreprocessed.txt содержит предварительно обработанные версии сонетов Шекспира. Файл содержит один сонет на строку со словами, разделенными пробелом. Извлеките текст из sonnetsPreprocessed.txt, разделите текст в документы в символах новой строки, и затем маркируйте документы.
filename = "sonnetsPreprocessed.txt";
str = extractFileText(filename);
textData = split(str,newline);
documents = tokenizedDocument(textData);Создайте модель сумки слов использование bagOfWords.
bag = bagOfWords(documents)
bag =
bagOfWords with properties:
Counts: [154x3092 double]
Vocabulary: [1x3092 string]
NumWords: 3092
NumDocuments: 154
Подбирайте модель LDA с 20 темами. Чтобы подавить многословный выход, установите 'Verbose' к 0.
numTopics = 20;
mdl = fitlda(bag,numTopics,'Verbose',0);Вычислите логарифмические вероятности документа учебных материалов и покажите им в гистограмме.
logProbabilities = logp(mdl,documents); figure histogram(logProbabilities) xlabel("Log Probability") ylabel("Frequency") title("Document Log-Probabilities")
Идентифицируйте эти три документа с самой низкой логарифмической вероятностью. Низкая логарифмическая вероятность может предположить, что документ может быть выбросом.
[~,idx] = sort(logProbabilities); idx(1:3)
ans = 3×1
146
19
65
documents(idx(1:3))
ans =
3x1 tokenizedDocument:
76 tokens: poor soul centre sinful earth sinful earth rebel powers array why dost thou pine suffer dearth painting thy outward walls costly gay why large cost short lease dost thou upon thy fading mansion spend shall worms inheritors excess eat up thy charge thy bodys end soul live thou upon thy servants loss let pine aggravate thy store buy terms divine selling hours dross fed rich shall thou feed death feeds men death once dead theres dying
76 tokens: devouring time blunt thou lions paws make earth devour own sweet brood pluck keen teeth fierce tigers jaws burn longlivd phoenix blood make glad sorry seasons thou fleets whateer thou wilt swiftfooted time wide world fading sweets forbid thee heinous crime o carve thy hours loves fair brow nor draw lines thine antique pen thy course untainted allow beautys pattern succeeding men yet thy worst old time despite thy wrong love shall verse ever live young
73 tokens: brass nor stone nor earth nor boundless sea sad mortality oersways power rage shall beauty hold plea whose action stronger flower o shall summers honey breath hold against wrackful siege battering days rocks impregnable stout nor gates steel strong time decays o fearful meditation alack shall times best jewel times chest lie hid strong hand hold swift foot back spoil beauty forbid o none unless miracle might black ink love still shine bright
Вычислите логарифмические вероятности документа из матрицы для подсчета количества слов
Загрузите данные в качестве примера. sonnetsCounts.mat содержит матрицу подсчетов слов и соответствующий словарь предварительно обработанных версий сонетов Шекспира.
load sonnetsCounts.mat
size(counts)ans = 1×2
154 3092
Подбирайте модель LDA с 20 темами.
numTopics = 20; mdl = fitlda(counts,numTopics)
Initial topic assignments sampled in 0.054622 seconds. ===================================================================================== | Iteration | Time per | Relative | Training | Topic | Topic | | | iteration | change in | perplexity | concentration | concentration | | | (seconds) | log(L) | | | iterations | ===================================================================================== | 0 | 0.10 | | 1.159e+03 | 5.000 | 0 | | 1 | 0.08 | 5.4884e-02 | 8.028e+02 | 5.000 | 0 | | 2 | 0.09 | 4.7400e-03 | 7.778e+02 | 5.000 | 0 | | 3 | 0.08 | 3.4597e-03 | 7.602e+02 | 5.000 | 0 | | 4 | 0.08 | 3.4662e-03 | 7.430e+02 | 5.000 | 0 | | 5 | 0.05 | 2.9259e-03 | 7.288e+02 | 5.000 | 0 | | 6 | 0.06 | 6.4180e-05 | 7.291e+02 | 5.000 | 0 | =====================================================================================
mdl =
ldaModel with properties:
NumTopics: 20
WordConcentration: 1
TopicConcentration: 5
CorpusTopicProbabilities: [1x20 double]
DocumentTopicProbabilities: [154x20 double]
TopicWordProbabilities: [3092x20 double]
Vocabulary: [1x3092 string]
TopicOrder: 'initial-fit-probability'
FitInfo: [1x1 struct]
Вычислите логарифмические вероятности документа учебных материалов. Задайте, чтобы чертить 500 выборок для каждого документа.
numSamples = 500; logProbabilities = logp(mdl,counts, ... 'NumSamples',numSamples);
Покажите логарифмические вероятности документа в гистограмме.
figure histogram(logProbabilities) xlabel("Log Probability") ylabel("Frequency") title("Document Log-Probabilities")
Идентифицируйте индексы этих трех документов с самой низкой логарифмической вероятностью.
[~,idx] = sort(logProbabilities); idx(1:3)
ans = 3×1
146
19
65
Сравните качество подгонки
Сравните качество подгонки для двух моделей LDA путем вычисления недоумения протянутого набора тестов документов.
Чтобы воспроизвести результаты, установите rng к 'default'.
rng('default')Загрузите данные в качестве примера. Файл sonnetsPreprocessed.txt содержит предварительно обработанные версии сонетов Шекспира. Файл содержит один сонет на строку со словами, разделенными пробелом. Извлеките текст из sonnetsPreprocessed.txt, разделите текст в документы в символах новой строки, и затем маркируйте документы.
filename = "sonnetsPreprocessed.txt";
str = extractFileText(filename);
textData = split(str,newline);
documents = tokenizedDocument(textData);Отложите 10% документов наугад для тестирования.
numDocuments = numel(documents);
cvp = cvpartition(numDocuments,'HoldOut',0.1);
documentsTrain = documents(cvp.training);
documentsTest = documents(cvp.test);Создайте модель сумки слов из учебных материалов.
bag = bagOfWords(documentsTrain)
bag =
bagOfWords with properties:
Counts: [139x2909 double]
Vocabulary: [1x2909 string]
NumWords: 2909
NumDocuments: 139
Подбирайте модель LDA с 20 темами к модели сумки слов. Чтобы подавить многословный выход, установите 'Verbose' к 0.
numTopics = 20;
mdl1 = fitlda(bag,numTopics,'Verbose',0);Просмотрите информацию о подгонке модели.
mdl1.FitInfo
ans = struct with fields:
TerminationCode: 1
TerminationStatus: "Relative tolerance on log-likelihood satisfied."
NumIterations: 26
NegativeLogLikelihood: 5.6915e+04
Perplexity: 742.7118
Solver: "cgs"
History: [1x1 struct]
Вычислите недоумение протянутого набора тестов.
[~,ppl1] = logp(mdl1,documentsTest)
ppl1 = 781.6078
Подбирайте модель LDA с 40 темами к модели сумки слов.
numTopics = 40;
mdl2 = fitlda(bag,numTopics,'Verbose',0);Просмотрите информацию о подгонке модели.
mdl2.FitInfo
ans = struct with fields:
TerminationCode: 1
TerminationStatus: "Relative tolerance on log-likelihood satisfied."
NumIterations: 37
NegativeLogLikelihood: 5.4466e+04
Perplexity: 558.8685
Solver: "cgs"
History: [1x1 struct]
Вычислите недоумение протянутого набора тестов.
[~,ppl2] = logp(mdl2,documentsTest)
ppl2 = 808.6602
Более низкое недоумение предполагает, что модель может быть лучшей подгонкой к протянутым тестовым данным.
Входные параметры
Выходные аргументы
Алгоритмы
logp использует выполненный с помощью итераций псевдометод счета, описанный в
Ссылки
[1] Уоллак, Ханна М., Иэн Мюррей, Руслан Салахутдинов и Дэвид Мимно. "Методы оценки для моделей темы". В Продолжениях 26-й ежегодной международной конференции по вопросам машинного обучения, стр 1105–1112. ACM, 2009. Гарвард