sampleNames

Класс: bioma.data.ExptData
Пакет: bioma.data

Получите или определите демонстрационные имена в объекте ExptData

Синтаксис

SamNames = sampleNames(EDObj) SamNames = sampleNames(EDObj, Subset) NewEDObj = sampleNames(EDObj, Subset, NewSamNames)

Описание

SamNames = sampleNames(EDObj) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий все демонстрационные имена в объекте ExptData.

SamNames = sampleNames(EDObj, Subset) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий подмножество демонстрационные имена в объекте ExptData.

NewEDObj = sampleNames(EDObj, Subset, NewSamNames) заменяет демонстрационные имена, заданные Subset в EDObj, объект ExptData, с NewSamNames, и возвращает NewEDObj, новый объект ExptData.

Входные параметры

EDObj

Объект bioma.data.ExptData класс.

Subset

Одно из следующих, чтобы задать подмножество выборки называет в объекте ExptData:

Вектор символов, задающий демонстрационное имя
Массив ячеек из символьных векторов, задающий демонстрационные имена
Положительное целое число
Вектор из положительных целых чисел
Логический вектор

NewSamNames

Новая выборка называет для определенных демонстрационных имен в объекте ExptData, заданном одним из следующего:

Числовой вектор
Вектор символов или массив ячеек из символьных векторов
Вектор символов, который sampleNames использование в качестве префикса для демонстрационных имен, с демонстрационными числами, добавленными к префиксу
Логический true или false (значение по умолчанию). Если true, sampleNames присваивает уникальные демонстрационные имена с помощью формата Sample1, Sample2, и т.д.

Количество демонстрационных имен в NewSamNames должен равняться количеству выборок, заданных Subset.

Выходные аргументы

`SamNames`	Массив ячеек из символьных векторов, задающий все или часть выборки, называет в объекте ExptData. Демонстрационные имена являются именами столбцов в объектах DataMatrix в объекте ExptData.
`NewEDObj`	Объект `bioma.data.ExptData` класс, возвращенный после заменяющий определенные демонстрационные имена.

Примеры

Создайте объект ExptData, и затем получите демонстрационные имена из него:

% Import bioma.data package to make constructor functions
% available
import bioma.data.*
% Create DataMatrix object from .txt file containing 
% expression values from microarray experiment
dmObj = DataMatrix('File', 'mouseExprsData.txt');
% Construct ExptData object
EDObj = ExptData(dmObj);
% Retrieve sample names
SNames = sampleNames(EDObj);

Темы

Представление значений данных выражения в объектах ExptData

Документация