exprprofrange

Вычислите область значений профилей экспрессии гена

Синтаксис

Range = exprprofrange(Data)
[Range, LogRange] = exprprofrange(Data)
... = exprprofrange(Data, 'ShowHist', ShowHistValue)

Аргументы

Data Объект DataMatrix или числовая матрица значений выражения, где каждая строка соответствует гену.
ShowHistValue

Управляет отображением гистограммы с данными об области значений. Значение по умолчанию:

  • false — Когда выходные значения заданы.

  • true — Когда выходные значения не заданы.

Описание

Range = exprprofrange(Data) вычисляет область значений каждого профиля выражения в Data, объект DataMatrix или числовая матрица значений выражения, где каждая строка соответствует гену.

[Range, LogRange] = exprprofrange(Data) возвращает логарифмическую область значений, то есть, log(max(prof))- log(min(prof)), из каждого профиля выражения. Если вы не задаете выходные аргументы, exprprofrange отображает столбиковую диаграмму гистограммы области значений.

... = exprprofrange(Data, 'ShowHist', ShowHistValue) управляет отображением гистограммы с данными об области значений. Выбор для ShowHistValue true или false.

Примеры

свернуть все

Загрузите микроданные массива, содержащие уровни экспрессии гена Saccharomyces cerevisiae (дрожжи).

load yeastdata

Этот MAT-файл включает три переменные, которые добавляются к рабочей области MATLAB®:

  • yeastvalues - Матрица A данных об экспрессии гена

  • гены - массив ячеек инвентарных номеров GenBank® для маркировки строк в yeastvalues

  • времена - вектор из временных стоимостей для маркировки столбцов в yeastvalues

Вычислите область значений профилей выражения для данных о дрожжах, когда экспрессия гена изменяется во время метаболического сдвига от ферментации до дыхания. И отобразите гистограмму данных.

range = exprprofrange(yeastvalues,'ShowHist',true);

Figure contains an axes. The axes with title Profile Ranges contains an object of type patch. This object represents absrange.

Смотрите также

|

Представлено до R2006a
Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте