Класс: BioIndexedFile
Получите алфавитно-цифровые ключи из исходного файла, сопоставленного с объектом BioIndexedFile
Keys
= getKeys(BioIFobj
)
возвращает Keys
= getKeys(BioIFobj
)Keys
, массив ячеек из символьных векторов, задающий все ключи к записям в исходном файле, сопоставлен с BioIFobj
, объект BioIndexedFile. Ключи появляются в том же порядке, как они делают в исходном файле, даже если они не уникальны.
|
Объект |
|
Массив ячеек из символьных векторов, задающий все ключи к записям в исходном файле. Ключи появляются в том же порядке, как они делают в исходном файле, даже если они не уникальны. |
Создайте объект BioIndexedFile получить доступ к таблице, содержащей перекрестные ссылки между условиями генной онтологии (GO) и названиями генов:
% Create variable containing full absolute path of source file sourcefile = which('yeastgenes.sgd'); % Create a BioIndexedFile object from the source file. Indicate % the source file is a tab-delimited file where contiguous rows % with the same key are considered a single entry. Store the % index file in the Current Folder. Indicate that keys are % located in column 3 and that header lines are prefaced with ! gene2goObj = BioIndexedFile('mrtab', sourcefile, '.', ... 'KeyColumn', 3, 'HeaderPrefix','!')
Получите все ключи для записей в исходном файле, затем просмотрите первые 12 ключей:
% Retrieve all keys for entries in gene2goObj keys = getKeys(gene2goObj); % View the first 12 keys keys(1:12)
ans = '15S_RRNA' '21S_RRNA' 'AAC1' 'AAC3' 'AAD10' 'AAD14' 'AAD15' 'AAD16' 'AAD3' 'AAD4' 'AAD6' 'AAH1'
Используйте этот метод, чтобы видеть полный список алфавитно-цифровых ключей в порядке, они происходят в исходном файле, из которого был создан объект BioIndexedFile.