SimBiology Model Builder

Создайте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии в интерактивном режиме

Описание

Приложение SimBiology Model Builder позволяет вам создать модели динамических систем, такие как модели количественной системной фармакологии (QSP), фармакокинетические/фармакодинамические модели (PK/PD) и модели системной биологии в интерактивном режиме. Это предоставляет редактор блок-схемы, чтобы создать реакцию модели, схематичную при помощи встроенных блоков.

Используя приложение, вы можете:

  • Создайте множество динамических систем, таких как метаболические сети, сигнальные трассы, модели QSP, модели PBPK и модели PK/PD.

  • Создайте стандартные разделенные на отсеки модели PK из встроенной библиотеки.

  • Просмотрите свою модель как графическое представление или как математические уравнения.

  • Используйте варианты, чтобы сохранить набор значений параметров или начальных условий, которые отличаются от настройки базовой модели.

  • Создайте массив доз, чтобы исследовать различные режимы дозирования.

  • Импортируйте или экспортируйте модели SimBiology в и из рабочей области MATLAB® или из файла Языка разметки системной биологии (SBML).

SimBiology Model Builder app

Откройте приложение SimBiology Model Builder

  • Панель инструментов MATLAB: На вкладке Apps, под Computational Biology, кликают по значку приложения.

  • Командная строка MATLAB: Войти simbiology.

Программируемое использование

развернуть все

simBiologyModelBuilder открывает приложение.

simBiologyModelBuilder(m1) открывает модель SimBiology m1 в приложении SimBiology Model Builder.

Если приложение SimBiology Model Builder или SimBiology Model Analyzer уже открыто, вы не можете загрузить модель или проект из командной строки. Загрузите модель из приложения непосредственно.

simBiologyModelBuilder(prjFile) открывает файл проекта prjFile в приложении SimBiology Model Builder. prjFile строка или вектор символов, задающий имя файла или путь и имя файла проекта SimBiology файл SBPROJ. Если вы задаете только имя файла, файл должен быть на пути поиска файлов MATLAB или в текущей папке.

Если приложение SimBiology Model Builder или SimBiology Model Analyzer уже открыто, вы не можете загрузить модель или проект из командной строки. Загрузите модель из приложения непосредственно.

Вопросы совместимости

развернуть все

Поведение изменяется в R2020b

Введенный в R2020b