SimBiology Model Analyzer

Анализируйте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии

Описание

Приложение SimBiology Model Analyzer позволяет вам анализировать модели динамических систем, такие как метаболические сети, сигнальные трассы, модели количественной системной фармакологии (QSP) и pharamacokinetic/pharmacodynamic модели (PK/PD) наркотиков. Это предоставляет несколько методов, чтобы анализировать модели и различные графики визуализировать результаты.

Используя приложение, вы можете:

  • Симулируйте модель, чтобы видеть ее динамическое поведение в зависимости от времени.

  • Исследуйте биологическую изменчивость путем симуляции альтернативных сценариев, таких как виртуальные пациенты.

  • Оцените параметры модели с помощью нелинейной регрессии и нелинейных методов смешанных эффектов.

  • Выполните сканы параметра и анализ чувствительности, чтобы исследовать влияние параметров модели и начальных условий на поведении модели.

  • Задайте модули и позвольте приложению автоматически преобразовать соответствующие физические количества в одну сопоставимую модульную систему.

  • Исследуйте различные режимы дозирования.

  • Выполните неразделенный на отсеки анализ (NCA), чтобы вычислить параметры PK препарата из его данных PK.

  • Просмотрите результаты анализа в различных графиках.

Доступные графики

Приложение позволяет вам визуализировать результаты анализа с помощью различных графиков, включая:

  • Курс времени количеств модели

  • Матрица чувствительности

  • Наложение предполагаемых результатов на экспериментальных данных

  • Графики измерить подходящее качество, такое как доверительный интервал строит, графики остаточных значений, остаточные графики распределения, actual-predicted графики и диаграммы

  • Матрица графика поля точек

SimBiology Model Analyzer app

Откройте приложение SimBiology Model Analyzer

  • Панель инструментов MATLAB®: На вкладке Apps, под Computational Biology, кликают по значку приложения.

  • Командная строка MATLAB: Войти simBiologyModelAnalyzer.

Программируемое использование

развернуть все

simBiologyModelAnalyzer открывает приложение SimBiology Model Analyzer.

simBiologyModelAnalyzer(m1) открывает модель SimBiology m1 в приложении SimBiology Model Analyzer.

Если приложение SimBiology Model Builder или SimBiology Model Analyzer уже открыто, вы не можете загрузить модель или проект из командной строки. Загрузите модель из приложения непосредственно.

simBiologyModelAnalyzer(prjFile) открывает файл проекта prjFile в приложении SimBiology Model Analyzer. file строка или вектор символов, задающий имя файла или путь и имя файла проекта SimBiology файл SBPROJ. Если вы задаете только имя файла, файл должен быть на пути поиска файлов MATLAB или в текущей папке.

Если приложение SimBiology Model Builder или SimBiology Model Analyzer уже открыто, вы не можете загрузить модель или проект из командной строки. Загрузите модель из приложения непосредственно.

Вопросы совместимости

развернуть все

Поведение изменяется в R2020b

Введенный в R2019b