Можно импортировать табличные данные к приложению SimBiology Model Analyzer или к MATLAB® Workspace. Поддерживаемыми типами файлов являются файлы Excel® (.xls, .xlsx), текстовые файлы (.csv, .txt), и файлы SAS® XPORT (.xpt). Можно также указать, что данные находятся в отформатированном файле NONMEM®. Процесс импорта интерпретирует столбцы согласно определениям NONMEM. Для получения дополнительной информации смотрите Поддержку Импорта NONMEM Отформатированные Файлы.
Примечание
Если ваш набор данных содержит информацию о дозах, которая является данными о вливании, набор данных должен содержать уровень и не длительность вливания.
Независимо от того, ли включена модульная функциональность преобразования или прочь, дозирование в файле данных должно быть описано в суммах (или как amount/time для скорости введения). Unit Conversion по умолчанию выключено, таким образом, необходимо гарантировать, что модули для данных сопоставимы друг с другом. Если вы хотите включить модульное преобразование, смотрите Модульное Преобразование для Импортированных Данных.
Если вы создаете файл, содержащий данные о курсе времени, которые вы хотите импортировать в SimBiology для подбора кривой, создать файл данных со следующими столбцами:
Столбец группы — Задает текст, числовые, или категориальные значения. Например, можно использовать этот столбец, чтобы сгруппировать несколько индивидуумов в отдельные группы. Можно затем использовать эту группировку или категориальную информацию для иерархических подгонок. Этот столбец является дополнительным.
Столбец ID — Задает текст, числовые, или категориальные значения. Строки в файле, которые имеют то же значение столбца ID, для того же индивидуума. Этот столбец является дополнительным, если данные об измерении прибывают всего от одного индивидуума.
Столбец времени — Задает монотонно увеличивающие положительные значения в каждом ID, которые задают время дозы, измерений наблюдения и ковариационных измерений.
Нуль или больше столбцов дозирования — Создают один столбец дозирования для каждого дозируемого отсека. В каждом столбце задайте положительные значения, представляющие суммарные дозы, которые добавляются к разновидности. Использование NaN (не номер), чтобы указать, что никакая доза не была применена в требуемое время. Другими словами, задайте суммарную дозу как NaN когда наблюдение было зарегистрировано, но никакая доза не была применена.
Нуль или больше столбцов уровня — Задают положительные значения, нуль или NaN. Нуль задает бесконечный уровень и NaN указывает, что никакой уровень не применяется. Столбец уровня сопоставлен со столбцом дозирования и задает уровень, на котором введена доза. Например, если можно задать капельное внутривенное введение в Dose1 столбец, задайте его уровень в Rate1 столбец.
Нуль или больше столбцов наблюдения — Задают числовые значения или NaNNaN значения не задают то наблюдение, был зарегистрирован в требуемое время. Используйте NaN в течение многих времен, когда доза была применена, но никакое наблюдение не было зарегистрировано. Можно задать одно значение наблюдения в определенное время для каждого ID. То, когда вы имеете, реплицирует, задайте несколько значений наблюдения для того же момента времени путем добавления большего количества строк с той же временной стоимостью. Для примера смотрите строки 2 и 3 в снимке экрана ниже, где CentralConc имеет два измерения во время = 0.
Нуль или больше ковариационных столбцов — Задают текст, числовые, или категориальные значения или NaN. Каждое значение задает ковариационное значение в требуемое время. NaN значения указывают, что никакое ковариационное наблюдение не было зарегистрировано в требуемое время. SimBiology поддерживает только коварианты, которые не время, варьируясь. Например, смотрите Sex и столбцы Age в примере ниже. Для примера, который показывает, как использовать категории для подбора кривой, смотрите Оценку Специфичные для категории Параметры PK для Нескольких Индивидуумов.
Снимок экрана файла выборочных данных следует.
Можно загрузить демонстрационный файл Excel со следующего местоположения: matlabroot/examples/simbio/data/sample_data_simbiology.xlsx. matlabroot является корневым каталогом, где вы установили MATLAB. Можно также войти matlabroot в командной строке, чтобы видеть путь к файлу корневого каталога.
Можно указать, что данные находятся в отформатированном файле NONMEM. Следующая таблица подсвечивает интерпретацию этих данных в программном обеспечении SimBiology®.
| Заголовок столбца | Интерпретация | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID | Текст (вектор символов), числовые, или категориальные значения, которые идентифицируют запись или группу. Процесс импорта принимает, что непрерывные данные с тем же значением содержат данные от одного индивидуума. Если данные содержат ссылки, состоящие из нескольких несмежных участков, на то же значение, присвоения процесса импорта, второй ID столкнулся с индексируемым, оцененным выведенный из группы, с которой сначала сталкиваются. Например, если столбцы ID содержат | ||||||||||
TIME | Монотонно увеличивающие положительные значения в каждой группе, указывая время наблюдения или дозы или текста (вектор символов). Файл данных может задать часы ( Следующая таблица является примером того, как процесс импорта интерпретирует значения часов как десятичные значения.
Если файл данных также содержит | ||||||||||
DATE, DAT1, DAT2, or DAT3 | Задает день наблюдения или дозы. Столбец может содержать месяц как номер (
Примечание
| ||||||||||
DV | Числовое значение наблюдения. Столбец не может содержать Inf или –Inf. | ||||||||||
MDV | Задает, описывает ли строка наблюдение:
| ||||||||||
EVID | Задает тип события, описанного для строки в записи:
Если столбец содержит значения для дозы, но Если Процесс импорта не поддерживает значения | ||||||||||
CMT | Указывает, какой отсек используется для значения наблюдения или для полученной дозы. Интерпретация также зависит от EVID:
Примечание Отсеки чисел SimBiology начиная с 1, в то время как числа NONMEM их начиная с 0. Например, если файл данных NONMEM содержит дозы и измерения для | ||||||||||
AMT | Доза указания положительного числа. 0 или NaN не задает введенной дозы. Столбец не может содержать Inf. | ||||||||||
RATE | Уровень указания положительного числа вливания. 0 задает бесконечный уровень (эквивалентный дозе шарика), и NaN не задает уровня. Столбец не может содержать Inf. | ||||||||||
II | Положительное число, задающее время между дозами. | ||||||||||
ADDL | Когда данные задают много идентичных последовательных доз в определенных интервалах (заданный II), ADDL задает количество доз в ряду, исключая начальную дозу. Если данные задают II но не ADDL, затем SimBiology принимает, что дозирование происходит на время той записи данных. |
Процесс импорта не поддерживает (и поэтому игнорирует), строки, содержащие следующие значения или определения:
EVID значения 3 и 4
SS столбец для определения доз устойчивого состояния
PCMT столбец, чтобы задать, вычислить ли предсказание для строки
CALL столбец для вызова ОШИБКИ или стандартной подпрограммы PK
Если уровень задан как бывший меньше нуля, он принят, чтобы быть нулем
Когда вы импортируете данные из таблицы с помощью SimBiology Model Analyzer, поддержек приложений следующие типы данных столбца: double'char', массив ячеек из символьных векторов, categoricalдлительностьлогический, и datetime.
Когда вы импортируете многомерный SimData массив к приложению, приложение сглаживает SimData массив и использование один индекс (линейная индексация) в соответствующей таблице данных. Например, если вы импортируете 2x2x2 Массив SimData A, приложение создает таблицу данных с 8 группами (один для каждого SimData объект), индексируя от 1 до 8. Приложение все еще отображает первоначальный размер SimData массив в Browser.
