Exponenta Banner
exponenta event banner

getInfo

Класс: BioMap

Получение информации для одного элемента BioMap объект

Синтаксис

Info = getInfo(BioObj, Element)

Описание

Info = getInfo(BioObj, Element) прибыль Info, вектор символов с разделителями табуляции, содержащий информацию об одном элементе в BioObj, a BioMap объект.

Входные аргументы

BioObj

Объект BioMap класс.

Element

Одно из следующих действий для указания одного элемента в BioObj:

  • Скаляр, указывающий индекс элемента

  • Логический вектор

  • Символьный вектор, содержащий допустимый заголовок последовательности

Выходные аргументы

Info

Вектор символов с разделителями табуляции, содержащий информацию об одном элементе в BioObj, a BioMap объект. Символьный вектор содержит информацию из следующих свойств по порядку:

  • Header

  • Flag

  • Start

  • MappingQuality

  • Signature

  • Sequence

  • Quality

Примеры

Построить BioMap , а затем получить информацию для второго элемента в объекте:

% Construct a BioMap object from a SAM file 
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve information for the second element in the object
element2Info = getInfo(BMObj1, 2)
element2Info =

EAS54_65:7:152:368:113	73	3	99	35M	
CTAGTGGCTCATTGTAAATGTGTGGTTTAACTCGT	
<<<<<<<<<<0<<<<655<<7<<<:9<<3/:<6):

См. также

Темы

Внешние веб-сайты

Документация по инструментарию биоинформатики

Поддержка