exponenta event banner

Высокопроизводительное секвенирование

Экспрессия генов, фактор транскрипции и анализ метилирования данных секвенирования следующего поколения (NGS), включая РНК-Seq и ChIP-Seq

Высокопроизводительные методы секвенирования генерируют большие объемы данных последовательности и требуют надежных вычислительных инструментов для дальнейшего анализа. Биоинформатика Toolbox™ предоставляет алгоритмы для поддержки общих рабочих процессов анализа данных секвенирования следующего поколения (NGS), таких как фильтрация и обрезка чтений, отображение чтений на ссылки, подсчет количества чтений, сопоставленных с геномными особенностями, и выполнение статистического анализа.

  • Импорт данных
    Импорт данных и аннотаций элементов NGS из файлов SAM, BAM, FASTA, FASTQ, GTF и GFF
  • Предварительная обработка
    Управление данными NGS с одинарными и парными считываниями, фильтрация и обрезка считываний, а также отображение статистики качества
  • Выравнивание
    Чтение карты в ссылочную последовательность (последовательности)
  • Статистический анализ
    Читать сводку и статистический анализ данных RNA-seq и ChIP-seq
  • Визуализация
    Визуализация выравнивания операций чтения по ссылочным последовательностям

Характерные примеры