Функции масс-спектрометрии предварительно обрабатывают и классифицируют необработанные данные спектрометров SELDI-TOF и MALDI-TOF и используют функции статистического обучения для идентификации закономерностей.
Чтение необработанных данных - загрузка необработанных данных массы/заряда и интенсивности ионов из CSV-файлов или чтение файла в формате JCAMP-DX с данными масс-спектрометрии (jcampread) в среду MATLAB ®.
Можно также иметь данные в файлах TXT и использовать importdata функция.
Предварительная обработка необработанных данных - повторная выборка данных с высоким разрешением на более низкое разрешение (msresample), где дополнительные точки данных не нужны. Исправить базовую линию (msbackadj). Выровнять спектр по набору эталонных масс (msalign) и визуально проверить центровку (msheatmap). Нормализовать площадь между спектрами для сравнения (msnorm) и отфильтровывать шум (mslowess и mssgolay).
Анализ спектра - спектры нагрузки в GUI (msviewer) для выбора массовых пиков и дальнейшего анализа.
На следующем рисунке показаны роли различных функций масс-спектрометрии в панели инструментов.
