Exponenta Banner
exponenta event banner

verify (model, variant)

Проверьте и проверьте модель SimBiology

Свернуть все на странице

Синтаксис

verify(modelObj)
verify(modelObj,csObj)
verify(modelObj,dvObj)
verify(modelObj,csObj,dvObj)
verify(modelObj,csObj,variantObj,doseObj)

Описание

пример

verify(modelObj) выполняет проверки на Model modelObj чтобы убедиться, что вы можете симулировать модель. Эта функция генерирует сложенные ошибки и предупреждения, если она находит какие-либо проблемы. Чтобы увидеть весь список ошибок и предупреждений, используйте sbiolasterror и sbiolastwarning. Функция использует активную конфигурацию модели, любые активные дозы и активные варианты для верификации.

пример

verify(modelObj,csObj) проверяет модель modelObj использование заданного объекта конфигурации csObj и любые активные варианты и активные дозы. Любые другие конфигурационные параметры игнорируются. Если вы задаете csObj в пустые []функция использует активный конфигурационный набор.

пример

verify(modelObj,dvObj) проверяет модель modelObj использование доз или вариантов, заданных dvObj и активный конфигурационный набор. dvObj может быть одним из следующих:

Если вы задаете dvObj в пустые []функция использует активный набор настроек, активные варианты и активные дозы.

Если вы задаете dvObj в качестве вариантов функция использует указанные варианты и активные дозы. Любые другие варианты игнорируются.

Если вы задаете dvObj в качестве доз функция использует указанные дозы и активные варианты. Любые другие дозы игнорируются.

пример

verify(modelObj,csObj,dvObj) проверяет модель modelObj использование объекта configset csObj и дозы или варианты, заданные dvObj.

Если вы задаете csObj на [], тогда функция использует активный объект configset.

Если вы задаете dvObj на [], тогда функция не использует никаких вариантов, но использует активные дозы.

Если вы задаете dvObj в качестве вариантов функция использует указанные варианты и активные дозы. Любые другие варианты игнорируются.

Если вы задаете dvObj в качестве доз функция использует указанные дозы и активные варианты. Любые другие дозы игнорируются.

пример

verify(modelObj,csObj,variantObj,doseObj) проверяет модель modelObj использование объекта configset csObj, варианты (variantObj) и дозы (doseObj). Любой другой набор настроек, дозы и варианты игнорируются.

Если вы задаете csObj на [], тогда функция использует активный объект configset.

Если вы задаете variantObj на []тогда функция не использует никаких вариантов.

Если вы задаете doseObj на [], тогда функция не использует никаких доз.

Входные параметры

свернуть все

Модель SimBiology, заданная как объект модели SimBiology.

Объект конфигурации модели, заданный как a Configset object который хранит специфическую для симуляции информацию.

Доза или объект варианта, заданный как a ScheduleDose object , RepeatDose object , массив объектов дозы, Variant object , или массив исполнительных объектов.

  • Когда dvObj является объектом дозы, verify использует указанный объект дозы, а также любые активные объекты варианта при наличии.

  • Когда dvObj является вариантом объекта, verify использует указанный объект варианта, а также любые активные объекты дозы, если они доступны.

Объект варианта, заданный как a Variant object или массив исполнительных объектов.

Объект дозы, заданный как ScheduleDose object , RepeatDose object , или массив объектов дозы. Объект дозы определяет сложения, которые вносятся в количества видов или значения параметров.

Примеры

свернуть все

Открыть Live Script

Загрузите образец модели SimBiology.

sbioloadproject radiodecay.sbproj

Добавьте новую конфигурацию модели с другим временем остановки 15 секунд. 

csObj = addconfigset(m1,'newStopTimeConfigSet');
csObj.StopTime = 15;

Проверьте модель при использовании объекта configset. 

verify(m1,csObj);

После верификации проверьте последние ошибки и предупреждения, если таковые имеются. 

sbiolasterror
ans = 

  0x1 empty struct array with fields:

    Type
    MessageID
    Message

sbiolastwarning
ans = 

  0x1 empty struct array with fields:

    Type
    MessageID
    Message

Симулируйте модель. 

sim = sbiosimulate(m1,csObj);
sbioplot(sim);

Figure contains an axes. The axes with title States versus Time contains 2 objects of type line. These objects represent x, z.

Открыть Live Script

Загрузите образец модели SimBiology.

sbioloadproject radiodecay.sbproj

Получите конфигурацию модели по умолчанию из модели. 

defaultConfigSet = getconfigset(m1,'default');

Добавьте запланированную дозу 100 молекул за 2 секунды для видов x. 

dObj = adddose(m1,'d1','schedule');
dObj.Amount = 100;
dObj.AmountUnits = 'molecule';
dObj.TimeUnits = 'second';
dObj.Time = 2;
dObj.TargetName = 'unnamed.x';

Проверьте модель при использовании объекта конфигурации по умолчанию и добавленного объекта дозы. 

verify(m1,defaultConfigSet,dObj);

После верификации проверьте последние ошибки и предупреждения, если таковые имеются. 

sbiolasterror
ans = 

  0x1 empty struct array with fields:

    Type
    MessageID
    Message

sbiolastwarning
ans = 

  0x1 empty struct array with fields:

    Type
    MessageID
    Message

Симулируйте модель с помощью тех же объектов конфигурации и дозы. 

sim = sbiosimulate(m1,defaultConfigSet,dObj);

Постройте график результата. 

sbioplot(sim);

Figure contains an axes. The axes with title States versus Time contains 2 objects of type line. These objects represent x, z.

Открыть Live Script

Загрузите образец модели SimBiology. 

sbioloadproject radiodecay.sbproj

Добавьте новую конфигурацию модели с другим временем остановки 15 секунд. 

csObj = m1.addconfigset('newStopTimeConfigSet');
csObj.StopTime = 15;

Добавьте запланированную дозу 100 молекул за 2 секунды для видов x. 

dObj = adddose(m1,'d1','schedule');
dObj.Amount = 100;
dObj.AmountUnits = 'molecule';
dObj.TimeUnits = 'second';
dObj.Time = 2;
dObj.TargetName = 'unnamed.x';

Добавьте вариант вида x использование другого начального количества 500 молекул. 

vObj = addvariant(m1,'v1');
addcontent(vObj,{'species','x','InitialAmount',500});

Проверьте модель при использовании объектов конфигурации, дозы и варианта. Обратите внимание, что порядок аргументов должен быть таким, как описано. 

verify(m1,csObj,vObj,dObj);

После верификации проверьте последние ошибки и предупреждения, если таковые имеются. 

sbiolasterror
ans = 

  0x1 empty struct array with fields:

    Type
    MessageID
    Message

sbiolastwarning
ans = 

  0x1 empty struct array with fields:

    Type
    MessageID
    Message

Симулируйте модель с помощью тех же объектов конфигурации, варианта и дозы. 

sim = sbiosimulate(m1,csObj,vObj,dObj);

Постройте график результата. 

sbioplot(sim);

Figure contains an axes. The axes with title States versus Time contains 2 objects of type line. These objects represent x, z.

См. также

sbiolasterror, sbiolastwarning

Введенный в R2006a

Документация SimBiology

Поддержка