logp
Логарифмические вероятности и качество подгонки модели LDA
Синтаксис
Описание
___ = logp(___, задает дополнительные опции, используя один или несколько аргументы пары "имя-значение".Name,Value)
Примеры
Вычисление вероятностей журнала документов
Чтобы воспроизвести результаты в этом примере, установите rng на 'default'.
rng('default')Загрузите данные примера. Файл sonnetsPreprocessed.txt содержит предварительно обработанные версии сонетов Шекспира. Файл содержит по одному сонету на линию со словами, разделенными пространством. Извлеките текст из sonnetsPreprocessed.txtразделите текст на документы в символах новой строки, а затем пометьте его токеном.
filename = "sonnetsPreprocessed.txt";
str = extractFileText(filename);
textData = split(str,newline);
documents = tokenizedDocument(textData);Создайте модель мешка слов с помощью bagOfWords.
bag = bagOfWords(documents)
bag =
bagOfWords with properties:
Counts: [154x3092 double]
Vocabulary: [1x3092 string]
NumWords: 3092
NumDocuments: 154
Подгонка модели LDA с 20 темами. Чтобы подавить подробный выход, установите 'Verbose' в 0.
numTopics = 20;
mdl = fitlda(bag,numTopics,'Verbose',0);Вычислите логарифмические вероятности документов обучения и отобразите их на гистограмме.
logProbabilities = logp(mdl,documents); figure histogram(logProbabilities) xlabel("Log Probability") ylabel("Frequency") title("Document Log-Probabilities")
Идентифицируйте три документа с самой низкой логарифмической вероятностью. Низкая логарифмическая вероятность может предположить, что документ может быть выбросами.
[~,idx] = sort(logProbabilities); idx(1:3)
ans = 3×1
146
19
65
documents(idx(1:3))
ans =
3x1 tokenizedDocument:
76 tokens: poor soul centre sinful earth sinful earth rebel powers array why dost thou pine suffer dearth painting thy outward walls costly gay why large cost short lease dost thou upon thy fading mansion spend shall worms inheritors excess eat up thy charge thy bodys end soul live thou upon thy servants loss let pine aggravate thy store buy terms divine selling hours dross fed rich shall thou feed death feeds men death once dead theres dying
76 tokens: devouring time blunt thou lions paws make earth devour own sweet brood pluck keen teeth fierce tigers jaws burn longlivd phoenix blood make glad sorry seasons thou fleets whateer thou wilt swiftfooted time wide world fading sweets forbid thee heinous crime o carve thy hours loves fair brow nor draw lines thine antique pen thy course untainted allow beautys pattern succeeding men yet thy worst old time despite thy wrong love shall verse ever live young
73 tokens: brass nor stone nor earth nor boundless sea sad mortality oersways power rage shall beauty hold plea whose action stronger flower o shall summers honey breath hold against wrackful siege battering days rocks impregnable stout nor gates steel strong time decays o fearful meditation alack shall times best jewel times chest lie hid strong hand hold swift foot back spoil beauty forbid o none unless miracle might black ink love still shine bright
Вычисление логарифмических вероятностей документа из матрицы count слов
Загрузите данные примера. sonnetsCounts.mat содержит матрицу отсчётов слов и соответствующий словарь предварительно обработанных версий сонетов Шекспира.
load sonnetsCounts.mat
size(counts)ans = 1×2
154 3092
Подгонка модели LDA с 20 темами.
numTopics = 20; mdl = fitlda(counts,numTopics)
Initial topic assignments sampled in 0.039264 seconds. ===================================================================================== | Iteration | Time per | Relative | Training | Topic | Topic | | | iteration | change in | perplexity | concentration | concentration | | | (seconds) | log(L) | | | iterations | ===================================================================================== | 0 | 0.26 | | 1.159e+03 | 5.000 | 0 | | 1 | 0.14 | 5.4884e-02 | 8.028e+02 | 5.000 | 0 | | 2 | 0.11 | 4.7400e-03 | 7.778e+02 | 5.000 | 0 | | 3 | 0.10 | 3.4597e-03 | 7.602e+02 | 5.000 | 0 | | 4 | 0.13 | 3.4662e-03 | 7.430e+02 | 5.000 | 0 | | 5 | 0.03 | 2.9259e-03 | 7.288e+02 | 5.000 | 0 | | 6 | 0.10 | 6.4180e-05 | 7.291e+02 | 5.000 | 0 | =====================================================================================
mdl =
ldaModel with properties:
NumTopics: 20
WordConcentration: 1
TopicConcentration: 5
CorpusTopicProbabilities: [1x20 double]
DocumentTopicProbabilities: [154x20 double]
TopicWordProbabilities: [3092x20 double]
Vocabulary: [1x3092 string]
TopicOrder: 'initial-fit-probability'
FitInfo: [1x1 struct]
Вычислите логарифмические вероятности документов обучения. Укажите, чтобы нарисовать 500 выборки для каждого документа.
numSamples = 500; logProbabilities = logp(mdl,counts, ... 'NumSamples',numSamples);
Отобразите логарифмические вероятности документа в гистограмме.
figure histogram(logProbabilities) xlabel("Log Probability") ylabel("Frequency") title("Document Log-Probabilities")
Идентифицируйте индексы трех документов с самой низкой логарифмической вероятностью.
[~,idx] = sort(logProbabilities); idx(1:3)
ans = 3×1
146
19
65
Сравнение качества подгонки
Сравните качество подгонки для двух моделей LDA путем вычисления недоумения задержанного тестового набора документов.
Чтобы воспроизвести результаты, установите rng на 'default'.
rng('default')Загрузите данные примера. Файл sonnetsPreprocessed.txt содержит предварительно обработанные версии сонетов Шекспира. Файл содержит по одному сонету на линию со словами, разделенными пространством. Извлеките текст из sonnetsPreprocessed.txtразделите текст на документы в символах новой строки, а затем пометьте его токеном.
filename = "sonnetsPreprocessed.txt";
str = extractFileText(filename);
textData = split(str,newline);
documents = tokenizedDocument(textData);Отложите 10% документов наугад для проверки.
numDocuments = numel(documents);
cvp = cvpartition(numDocuments,'HoldOut',0.1);
documentsTrain = documents(cvp.training);
documentsTest = documents(cvp.test);Создайте модель мешка слов из обучающих документов.
bag = bagOfWords(documentsTrain)
bag =
bagOfWords with properties:
Counts: [139x2909 double]
Vocabulary: [1x2909 string]
NumWords: 2909
NumDocuments: 139
Подгонка модели LDA с 20 темами к модели мешка слов. Чтобы подавить подробный выход, установите 'Verbose' в 0.
numTopics = 20;
mdl1 = fitlda(bag,numTopics,'Verbose',0);Просмотрите информацию о модели подгонки.
mdl1.FitInfo
ans = struct with fields:
TerminationCode: 1
TerminationStatus: "Relative tolerance on log-likelihood satisfied."
NumIterations: 26
NegativeLogLikelihood: 5.6915e+04
Perplexity: 742.7118
Solver: "cgs"
History: [1x1 struct]
Вычислите недоумение удерживаемого тестового набора.
[~,ppl1] = logp(mdl1,documentsTest)
ppl1 = 781.6078
Подгонка модели LDA с 40 темами к модели мешка слов.
numTopics = 40;
mdl2 = fitlda(bag,numTopics,'Verbose',0);Просмотрите информацию о модели подгонки.
mdl2.FitInfo
ans = struct with fields:
TerminationCode: 1
TerminationStatus: "Relative tolerance on log-likelihood satisfied."
NumIterations: 37
NegativeLogLikelihood: 5.4466e+04
Perplexity: 558.8685
Solver: "cgs"
History: [1x1 struct]
Вычислите недоумение удерживаемого тестового набора.
[~,ppl2] = logp(mdl2,documentsTest)
ppl2 = 808.6602
Более низкая недоумение предполагает, что модель может быть лучше подгонка к удерживаемым тестовым данным.
Входные параметры
Выходные аргументы
Алгоритмы
logp использует итерационный метод псевдосчета, описанный в
Ссылки
[1] Валлах, Ханна М., Айен Мюррей, Руслан Салахутдинов и Дэвид Мимно. «Методы оценки для моделей». В Трудах 26-й ежегодной международной конференции по машинному обучению, стр. 1105-1112. ACM, 2009. Гарвард