featureNames

Класс: bioma.data.ExptData
Пакет: bioma.data

Получите или определите имена функции в объекте ExptData

Синтаксис

FeatNames = featureNames(EDObj) FeatNames = featureNames(EDObj, Subset) NewESObj = featureNames(EDObj, Subset, NewFeatNames)

Описание

FeatNames = featureNames(EDObj) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий все имена функции в объекте ExptData.

FeatNames = featureNames(EDObj, Subset) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий подмножество имена функции в объекте ExptData.

NewESObj = featureNames(EDObj, Subset, NewFeatNames) заменяет имена функции, заданные Subset в EDObj, объект ExptData, с NewFeatNames, и возвращает NewEDObj, новый объект ExptData.

Входные параметры

EDObj

Объект bioma.data.ExptData класс.

Subset

Одно из следующих, чтобы задать подмножество функции называет в объекте ExptData:

Вектор символов, задающий имя функции
Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена функции
Положительное целое число
Вектор из положительных целых чисел
Логический вектор

NewFeatNames

Новая возможность называет для определенных имен функции в объекте ExptData, заданном одним из следующего:

Числовой вектор
Вектор символов или массив ячеек из символьных векторов
Вектор символов, который featureNames использование в качестве префикса для имен функции, с числами функции, добавленными к префиксу
Логический true или false (значение по умолчанию). Если true, featureNames имена уникальной функции присвоений с помощью формата Feature1, Feature2, и т.д.

Количество функции называет в NewFeatNames должен равняться количеству функций, заданных Subset.

Выходные аргументы

`FeatNames`	Массив ячеек из символьных векторов, задающий все или часть функции, называет в объекте ExptData. Имена функции являются именами строки в объектах DataMatrix в объекте ExptData.
`NewEDObj`	Объект `bioma.data.ExptData` класс, возвращенный после заменяющий определенные имена функции.

Примеры

Создайте объект ExptData, и затем получите имена функции из него:

% Import bioma.data package to make constructor functions
% available
import bioma.data.*
% Create DataMatrix object from .txt file containing 
% expression values from microarray experiment
dmObj = DataMatrix('File', 'mouseExprsData.txt');
% Construct ExptData object
EDObj = ExptData(dmObj);
% Retrieve feature names
FNames = featureNames(EDObj);

Темы

Представление значений данных выражения в объектах ExptData

Документация