Получите информацию о филогенетическом древовидном объекте
[Value1, Value2,...] =
get(Tree, 'Property1','Property2',...)
get(Tree)
V = get(Tree)
Tree | Объект Phytree создается с функцией phytree. |
Name | Имя свойства phytree объект. |
[ возвращает заданные свойства в объект phytree (Value1, Value2,...] =
get(Tree, 'Property1','Property2',...)Tree).
Свойства для phytree объект перечислен в следующей таблице.
| Свойство | Описание |
|---|---|
NumLeaves | Количество листов |
NumBranches | Количество ветвей |
NumNodes | Количество узлов (NumLeaves + NumBranches) |
Pointers | Перейдите к списку возможностей соединения листа/ветви |
Distances | Длина ребра для каждого листа/ветви |
LeafNames | Имена листов |
BranchNames | Имена ветвей |
NodeNames | Имена всех узлов |
get( отображения все имена свойства и их текущие значения для объекта phytree (Tree)Tree).
V = get(Tree)Tree) и каждое поле содержит значение того свойства.
Читайте в филогенетическом дереве из файла.
tr = phytreeread('pf00002.tree')
Phylogenetic tree object with 33 leaves (32 branches)Получите имена листов.
protein_names = get(tr,'LeafNames')
protein_names =
'Q9YHC6_RANRI/126-382'
'VIPR1_RAT/140-397'
'VIPR_CARAU/100-359'
...