getRange

Класс: GFFAnnotation

Получите область значений аннотаций от GFFAnnotation объект

Синтаксис

Range = getRange(AnnotObj)

Описание

Range = getRange(AnnotObj) возвращает Range, 1 2 числовой массив, задающий минимальные и максимальные положения в ссылочной последовательности, охвачен аннотациями в AnnotObj.

Входные параметры

AnnotObj

Объект GFFAnnotation класс.

Выходные аргументы

Range

1 2 числовой массив, задающий минимальные и максимальные положения в ссылочной последовательности, охвачен аннотациями в AnnotObj

Примеры

Создайте a GFFAnnotation объект из GFF-отформатированного файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем возвращает область значений аннотаций функции:

% Construct a GFFAnnotation object from a GFF file
GFFAnnotObj = GFFAnnotation('tair8_1.gff');
% Return first and last positions of reference associated with feature annotations
range = getRange(GFFAnnotObj)
range =

        3631      498516

Советы

  • Используйте getSubset метод с Reference пара "имя-значение", чтобы возвратить a GFFAnnotation объект, содержащий только одну ссылочную последовательность. Затем используйте этот объект из подмножества, как введено для getRange метод.

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте