term class

Суперклассы:

Структура данных, содержащая информацию о термине Генной онтологии (GO)

Описание

Объект термина является структурой данных, содержащей информацию о термине Генной онтологии (GO). Можно исследовать и пересечь Генные термины Онтологии с помощью “is_a” и “part_of” отношения.

Конструкция

geneontСоздайте geneont и term обьекты

Свойства

определениеВектор символов только для чтения, который задает, ИДЕТ термин
IDЧисловое значение только для чтения, которое соответствует, чтобы ПОЙТИ идентификатор, ИДЕТ термин
isaЧисловой массив только для чтения, содержащий, ИДЕТ, идентификаторы ИДУТ термины, которые имеют, “” отношение с этим, ИДУТ термин
имяИмя представления вектора символов только для чтения ИДЕТ термин
устаревшийБулево значение только для чтения, которое указывает, является ли ПОЙТИ термин устаревшим
онтологияВектор символов только для чтения, описывающий онтологию, ИДЕТ термин
part_ofЧисловой массив только для чтения, содержащий, ИДЕТ, идентификаторы ИДУТ термины, которые имеют “часть” отношения с этим, ИДУТ термин
синонимМассив только для чтения, содержащий, ИДЕТ термины, которые являются синонимами этого, ИДУТ термин

Иерархия экземпляра

Объект geneont содержит объекты термина.

Копировать семантику

Указатель. Чтобы изучить, как это влияет на ваше использование класса, смотрите Копирование Объектов в MATLAB® Документация Основ программирования.

Индексация

Можно использовать круглую скобку () индексирующий, чтобы получить доступ к терминам в массиве указателей, чтобы назвать объекты. Смотрите Примеры ниже.

Примеры

  1. Загрузите текущую версию базы данных Gene Ontology с сети в объект geneont в программном обеспечении MATLAB.

    GeneontObj = geneont('LIVE', true)

    Программное обеспечение MATLAB создает объект geneont и отображает количество объектов термина, сопоставленных с объектом geneont.

    Gene Ontology object with 27827 Terms.
  2. Используйте terms свойство создать переменную, содержащую массив указателей на термин объекты объекта geneont.

    array_of_terms = GeneontObj.terms
    
    27827x1 struct array with fields:
        id
        name
        ontology
        definition
        comment
        synonym
        is_a
        part_of
        obsolete

    Примечание

    Несмотря на то, что terms свойство является массивом указателей, чтобы назвать объекты в командном окне MATLAB, оно отображается, когда массив структур, с одной структурой для каждого ИДУТ термин в объекте geneont.

  3. Возвратите пятый термин (объект термина) объекта geneont.

    fifth_term = array_of_terms(5)
    
                id: 6
              name: [1x60 char]
          ontology: 'molecular function'
        definition: [1x321 char]
           comment: ''
           synonym: []
              is_a: 5385
           part_of: [0x1 double]
          obsolete: 0

Смотрите также

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте