getmatrix (phytree)

Преобразуйте объект phytree в матрицу отношения

Синтаксис

[Matrix, ID, Distances] = getmatrix(PhytreeObj)

Аргументы

PhytreeObj объект phytree, созданный phytree Конструктор Object.

Описание

[Matrix, ID, Distances] = getmatrix(PhytreeObj) преобразует объект phytree, PhytreeObj, в логическую разреженную матрицу, Matrix, в котором 1 указывает, что узел ветви (индекс строки) соединяется со своим дочерним элементом (индекс столбца). Дочерний элемент может быть или другим узлом ветви или вершиной. ID вектор-столбец строк, перечисляющих метки, которые соответствуют строкам и столбцам Matrix, с метками от 1 до Number of Leaves, являющегося вершинами, затем метки от Number of Leaves + 1 к Number of Leaves + Number of Branches, являющийся узлами ветви и меткой для последнего узла ветви, также являющегося корневым узлом. Distances вектор-столбец с одной записью для каждой ненулевой записи в Matrix пересеченный по столбцам и представление расстояния между узлом ветви и дочерним элементом.

Примеры

 T = phytreeread('pf00002.tree')
 [MATRIX, ID, DIST] = getmatrix(T); 
 

Смотрите также

| | | |

Представленный в R2006b