phytreeviewer

Визуализируйте, отредактируйте и исследуйте филогенетические древовидные данные

Описание

пример

phytreeviewer открывает приложение Phylogenetic Tree, которое позволяет вам просматривать, редактировать и исследовать филогенетические древовидные данные.

phytreeviewer(Tree) загружает phytree объект Tree в приложение.

phytreeviewer(File) данные о загрузках из дерева Newick или ClustalW отформатировали файл в приложение.

Входные параметры

свернуть все

Филогенетическое дерево в виде Phytree объект создал с функциями phytree или phytreeread.

Newick или дерево ClustalW отформатировали файл в виде вектора символов или строки, содержащей имя файла, путь и имя файла или URL, указывающий на файл.

Примеры

свернуть все

В этом примере показано, как просмотреть филогенетическое дерево.

Загрузите демонстрационное филогенетическое дерево.

tr= phytreeread('pf00002.tree')
    Phylogenetic tree object with 33 leaves (32 branches)

Просмотрите филогенетическое дерево.

phytreeviewer(tr)

Figure Phylogenetic Tree 1 contains an axes object. The axes object contains 72 objects of type line.

В качестве альтернативы можно нажать Phylogenetic Tree на вкладке Apps, чтобы открыть приложение и просмотреть филогенетический древовидный объект tr .

Смотрите также

| | | | |

Представленный в R2012b