Создайте блокированное изображение из демонстрационного изображения tumor_091R.tif. Это демонстрационное изображение является учебным изображением лимфатического узла, содержащего ткань опухоли от набора данных CAMELYON16. Изображение было изменено, чтобы иметь три крупных уровня разрешения и было настроено, чтобы осуществить сопоставимое соотношение сторон и указать функции на каждом уровне.

bim = blockedImage('tumor_091R.tif');

Отобразите целое блокированное изображение на самом прекрасном уровне разрешения, включая сетку контуров блока.

bshow = bigimageshow(bim,'ResolutionLevel','fine', ...
    'GridVisible','on','GridLevel',1);

Создайте маску самого грубого уровня разрешения.

Сначала создайте изображение одно разрешения самого грубого уровня разрешения. По умолчанию, gather функция получает данные из самого грубого уровня разрешения.

imcoarse = gather(bim);

Преобразуйте крупное изображение в шкалу полутонов.

graycoarse = rgb2gray(imcoarse);

Binarize полутоновое изображение. В двоичном изображении предмет интереса является черным, и фон является белым.

bwcoarse = imbinarize(graycoarse);

Возьмите дополнение двоичного изображения. Получившаяся маска следует соглашению, в котором предмет интереса является белым, и фон является черным.

mask = imcomplement(bwcoarse);

Создайте блокированное изображение, содержащее маску.

Используйте ту же пространственную ссылку в качестве исходного блокированного изображения. Определите самый грубый уровень разрешения и получите пространственную информацию о ссылке блокированного изображения в первых двух размерностях на том уровне.

coarsestLevel = bim.NumLevels;
originalWorldStartCoarsest = bim.WorldStart(coarsestLevel,1:2);
originalWorldEndCoarsest = bim.WorldEnd(coarsestLevel,1:2);

Создайте блокированное изображение для маски.

bmask = blockedImage(mask,'WorldStart',originalWorldStartCoarsest, ...
   'WorldEnd',originalWorldEndCoarsest);

Отобразите рисунок маски.

figure
bigimageshow(bmask)

Наложите маску на отображении исходного блокированного изображения с помощью showmask функция. Чтобы подсветить все блоки, которые содержат по крайней мере один ненулевой пиксель маски, задайте порог включения 0.

showmask(bshow,bmask,'InclusionThreshold',0)