niftiread

Считайте изображение NIfTI

Описание

пример

V = niftiread(filename) читает файл изображения NIfTI, заданный filename в текущей папке или на пути, и возвращает объемные данные в V. niftiread функционируйте поддерживает обоих NIfTI1 и NIfTI2 форматы файлов.

V = niftiread(headerfile,imgfile) читает заголовочный файл NIfTI (.hdr) и файл изображения (.img) пара.

пример

V = niftiread(info) читает файл NIfTI, описанный структурой метаданных info. Создать info структура, используйте niftiinfo функция

Примеры

свернуть все

Загрузите объемные данные из файла NIfTI. Файл использует объединенный формат NIfTI — изображение и метаданные находятся в том же файле. Этот тип файла NIfTI имеет .nii расширение файла.

V = niftiread('brain.nii');

Просмотрите переменную в рабочей области.

whos V
  Name        Size                  Bytes  Class    Attributes

  V         256x256x21            1376256  uint8              

Считайте метаданные из файла NIfTI.

info = niftiinfo('brain.nii');

Считайте объемное изображение с помощью структуры метаданных, возвращенной niftiinfo.

V = niftiread(info);

Просмотрите переменную в рабочей области.

whos V
  Name        Size                  Bytes  Class    Attributes

  V         256x256x21            1376256  uint8              

Входные параметры

свернуть все

Имя файла NIfTI в виде строкового скаляра или вектора символов. Файл может быть в NIfTI1 или NIfTI2 fileFormat .

  • Если вы не задаете расширение файла, то niftiread ищет файл с .nii расширение.

  • Если niftiread не может найти файл с .nii расширение, затем это ищет gzipped версию файла с дополнительным .nii.gz.

  • Если niftiread не может найти файл с .nii.gz расширение, затем это ищет файл с .hdr, .hdr.gzimg , или .img.gz расширение файла.

  • Если niftiread не может найти файл, который совпадает с любой из этих опций, затем он возвращает ошибку.

Типы данных: char | string

Имя файла, содержащего метаданные в виде строкового скаляра или вектора символов. Заголовочный файл NIfTI (.hdr) содержит метаданные, сопоставленные с объемом NIfTI. Если вы не задаете соответствующий imgfile, затем niftiread взгляды в той же папке для файла с тем же именем и дополнительным .img.

Типы данных: char | string

Имя файла, содержащего объем в виде строкового скаляра или вектора символов. Файл изображения NIfTI (.img) содержит данные об объеме. Если вы не задаете соответствующий заголовочный файл, то niftiread взгляды в той же папке для файла с тем же именем и дополнительным .hdr.

Типы данных: char | string

Метаданные файла NIfTI в виде структуры, возвращенной niftiinfo.

Типы данных: struct

Выходные аргументы

свернуть все

Объемные данные, возвращенные как числовой массив.

Больше о

свернуть все

Формат файла NIfTI

NIfTI (Нейроотображающий Технологическую Инициативу Информатики) является NIH-спонсируемой рабочей группой, чтобы способствовать функциональной совместимости функциональных программных инструментов нейрообработки изображений. NIfTI использует один или двойной формат хранилища файлов.

  • Двойной формат файла хранит данные в паре файлов: заголовочный файл (.hdr) содержа метаданные и файл данных (.img) содержа данные изображения.

  • Один формат файла хранит данные в одном файле (.nii), который содержит информацию о заголовке, сопровождаемую данными изображения.

Ссылки

[1] Cox, R. W. Дж. Ашбернер, Х. Бремен, К. Фисселл, К. Хэзелгроув, К. Дж. Холмс, Дж. Л. Ланкастер, Д. Э. Рекс, С. М. Смит, Дж. Б. Вудвард и С. К. Стразэ. "(Вид) новый стандарт формата данных изображения: NiFTI-1". 10-е Годовое собрание Организации Отображения Человеческого мозга, Будапешта, Венгрия, июнь 2004.

Смотрите также

|

Введенный в R2017b