Исследуйте структуру модели, валидность математических выражений и непротиворечивость модулей и инструментов верификации модели использования размерностей. Просмотрите базовые уравнения модели и проверяйте начальные условия в приложения или в командной строке.
| SimBiology Model Builder | Создайте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии в интерактивном режиме |
| SimBiology Model Analyzer | Анализируйте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии |
verify | Подтвердите и проверьте модель SimBiology |
getequations | Возвратите систему уравнений для объекта модели |
sbiolastwarning | SimBiology последнее предупреждающее сообщение |
sbiolasterror | SimBiology последнее сообщение об ошибке |
findUnusedComponents | Найдите неиспользованные разновидности, параметры и отсеки в модели |
findUsages | Узнайте, как разновидность, параметр или отсек используются в модели |
getadjacencymatrix (model) | Получите матрицу смежности от объекта модели |
getstoichmatrix (model) | Получите матрицу стехиометрии от объекта модели |
SimBiology® имеет функциональность, которая помогает вам найти и зафиксировать предупреждения, что вы можете должны быть знать, и ошибки, которые препятствовали бы тому, чтобы вы симулировали и анализировали свою модель.
Оценка имен компонента модели в выражениях
SimBiology следует некоторым правилам приоритета при оценке имен в выражениях.
SimBiology позволяет вам найти разновидности, параметры, отсеки и observables, которые не используются в модели и узнают, как они используются.
Определение матрицы смежности для модели
adjacency matrix является квадратной матрицей, которая предоставляет информацию о реагентах и продуктах реакций в модели.
Определение матрицы стехиометрии для модели
stoichiometry matrix предоставляет стехиометрическую информацию о реагентах и продуктах в реакциях модели.