Укажите на граничное условие разновидностей
BoundaryCondition
свойство указывает, имеет ли объект разновидностей граничное условие.
Когда BoundaryCondition
из разновидности false
(значение по умолчанию), количество разновидностей изменяется реакциями, правилами, событиями и дозами. Если BoundaryCondition
true
, количество разновидностей изменяется правилами, событиями и дозами, но не реакциями.
Установите BoundaryCondition
к true
когда это необходимо, разновидности, чтобы участвовать в реакции, но не хотят реакций изменить ее количество.
Весь SimBiology® разновидности являются переменными состояния независимо от BoundaryCondition
или ConstantAmount
свойство.
Рассмотрите следующие два варианта использования граничных условий:
Моделирование взаимодействий лиганда приемника, которые влияют на скорость изменения приемника, но не лиганда. Например, в ответ на гормон, приемники стероида, такие как глюкокортикоидный приемник (GR) перемещают от цитоплазмы (cyt
) к ядру (nuc
). Комплекс компаньонки hsp90/hsp70 направляет это ядерное перемещение [Пратт 2004]. Естественный лиганд для GR является кортизолом; синтетический гормональный дексаметазон (dex
) используется вместо кортизола в экспериментальных системах. В этой системе дексаметазон участвует в реакции, но количество дексаметазона в ячейке отрегулировано, использовав правило. К просто перемещению модели GR вы могли использовать следующие реакции:
Формирование комплекса приемника компаньонки,
Hsp90_complex + GR_cyt -> Hsp90_complex:GR_cyt
В ответ на синтетический гормональный дексаметазон (dex
), GR перемещается от цитоплазмы до ядра.
Hsp90_complex:GR_cyt + dex -> Hsp90_complex + GR_nuc + dex
dex
,BoundaryCondition = true; ConstantAmount = false
dex
моделируется как граничное условие с правилом отрегулировать скорость изменения dex
в системе. Здесь, количество dex
не определяется уровнем второй реакции, но правилом скорости такой какddex/dt = 0.001
dex = 0.001
Моделируя роль нуклеотидов (например, GTP, ATP, ЛАГЕРЬ) и кофакторы (например, приблизительно++, NAD+, коэнзим A). Рассмотрите роль GTP в активации Ras киназами тирозина приемника.
Ras-GDP + GTP -> Ras-GTP + GDP
For GTP, BoundaryCondition = true; ConstantAmount = true
GTP модели и GDP с граничными условиями, таким образом делая их граничными разновидностями. Кроме того, можно установить ConstantAmount
свойство этих разновидностей к true
указать, что их количество не варьируется во время симуляции.
Применяется | Объект: разновидности |
Тип данных | boolean |
Значения данных | true или false . Значением по умолчанию является false . |
Доступ | Чтение-запись |
Пратт, W.B., Гэлигниана, доктор медицины, Моришима, Y., Мерфи, P.J. (2004), Роль молекулярных компаньонок в действии приемника стероида, Биохимии Эссе, 40:41-58.